More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0622 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0622  cytochrome P450  100 
 
 
415 aa  845    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5387  cytochrome P450  63.68 
 
 
418 aa  543  1e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.659302  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1764  cytochrome P450  37.41 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1782  cytochrome P450  37.41 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1829  cytochrome P450  37.41 
 
 
418 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4150  cytochrome P450  37.01 
 
 
408 aa  220  5e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6889  cytochrome P450  36 
 
 
414 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2543  cytochrome P450  36.1 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2588  cytochrome P450  36.1 
 
 
405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.687766  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4339  cytochrome P450  35.37 
 
 
405 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.189726  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0364  cytochrome P450  35.25 
 
 
413 aa  207  4e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699807  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2007  cytochrome P450  34.59 
 
 
404 aa  203  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.284434 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2271  cytochrome P450  32.16 
 
 
405 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1912  cytochrome P450  31.39 
 
 
426 aa  180  4e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.997168  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0599  cytochrome P450  31.23 
 
 
425 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00925226  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0584  cytochrome P450  32.84 
 
 
395 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5154  cytochrome P450  31.07 
 
 
418 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5243  cytochrome P450  31.07 
 
 
406 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5535  cytochrome P450  31.07 
 
 
406 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0101021  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  28.71 
 
 
420 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6100  hypothetical protein  34.89 
 
 
411 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.293371  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0631  cytochrome P450  29.95 
 
 
427 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0627  cytochrome P450  31.6 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.913499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3187  cytochrome P450  30.49 
 
 
396 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25675  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6537  cytochrome P450  31.5 
 
 
427 aa  163  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.233268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4218  cytochrome P450  30.52 
 
 
395 aa  162  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.247532 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2330  putative cytochrome P450 hydroxylase(monooxygenase)  31.82 
 
 
417 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.998685  normal  0.217203 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2673  cytochrome P450  30.82 
 
 
411 aa  160  3e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.121827 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1856  cytochrome P450  32.35 
 
 
417 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.654752  normal  0.157092 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1885  cytochrome P450  33.02 
 
 
411 aa  160  3e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2448  cytochrome P450  31.12 
 
 
411 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0236  cytochrome P450  33.25 
 
 
402 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.58139  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2627  cytochrome P450  31.12 
 
 
411 aa  159  6e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  32.52 
 
 
426 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2651  cytochrome P450  31.17 
 
 
411 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0547  cytochrome P450  35.36 
 
 
406 aa  159  9e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.766662  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2410  cytochrome P450  30.82 
 
 
411 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.35632  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2645  cytochrome P450  30.82 
 
 
411 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000108493 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2696  cytochrome P450  30.82 
 
 
411 aa  158  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.8882  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4324  cytochrome P450  31.27 
 
 
395 aa  159  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2373  cytochrome P450  30.82 
 
 
411 aa  158  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.387274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1266  cytochrome P450  31.25 
 
 
393 aa  158  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0318577 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4631  cytochrome P450  33.52 
 
 
404 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4719  cytochrome P450  33.52 
 
 
404 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.211814  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3721  cytochrome P450  30.97 
 
 
400 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.153528  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3794  cytochrome P450  30.97 
 
 
400 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.209215 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2531  cytochrome P450  32.35 
 
 
408 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  33.52 
 
 
402 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  31.71 
 
 
407 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7099  cytochrome P450  31.23 
 
 
396 aa  157  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2513  cytochrome P450  30.79 
 
 
411 aa  156  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2654  cytochrome P450  30.86 
 
 
411 aa  156  7e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108549  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5013  cytochrome P450  33.24 
 
 
404 aa  155  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  33.33 
 
 
402 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3733  cytochrome P450  30.61 
 
 
400 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.123768  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1978  cytochrome P450  30.98 
 
 
388 aa  155  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.449143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4706  cytochrome P450  31.34 
 
 
405 aa  155  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15095  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2844  putative cytochrome P450  31.81 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.681869  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  32.18 
 
 
404 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4299  cytochrome P450  30.34 
 
 
406 aa  153  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.657054  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0973  cytochrome P450  31.25 
 
 
412 aa  153  5e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3863  cytochrome P450  30 
 
 
408 aa  153  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.793072  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3711  cytochrome P450  31.94 
 
 
405 aa  153  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5423  putative cytochrome P450  36.05 
 
 
430 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.105829  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5310  cytochrome P450  30.67 
 
 
394 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2913  cytochrome P450  32.45 
 
 
396 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1257  cytochrome P450  30.73 
 
 
395 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000160229 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3698  cytochrome P450  31.68 
 
 
405 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1541  cytochrome P450  32.13 
 
 
403 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2431  cytochrome P450  30.19 
 
 
413 aa  151  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3771  cytochrome P450  31.68 
 
 
405 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.369198 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3845  cytochrome P450  30.71 
 
 
414 aa  150  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.954157  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5017  cytochrome P450  30.42 
 
 
394 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.147849  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4929  cytochrome P450  30.42 
 
 
411 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4732  cytochrome P450  29.28 
 
 
398 aa  149  7e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1302  cytochrome P450  35.46 
 
 
400 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  31.2 
 
 
398 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4343  cytochrome P450  32.11 
 
 
412 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4596  cytochrome P450  35.12 
 
 
398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2479  cytochrome P450  31.89 
 
 
400 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0545  cytochrome P450  31.3 
 
 
408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4282  cytochrome P450  34.15 
 
 
415 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.215625  normal  0.686795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2582  cytochrome P450  29.07 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00028994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  31.56 
 
 
410 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9164  cytochrome P450  36.58 
 
 
399 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2513  cytochrome P450  30.17 
 
 
419 aa  147  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2312  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0642  cytochrome P450  32.73 
 
 
410 aa  147  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0366485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  34.06 
 
 
407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6122  putative cytochrome P450  32.83 
 
 
410 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290262  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  28.61 
 
 
402 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  33.25 
 
 
401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5009  putative cytochrome P450  35.78 
 
 
357 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1195  cytochrome P450  35.09 
 
 
394 aa  146  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  33.33 
 
 
402 aa  146  5e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0944  cytochrome P450  31.68 
 
 
396 aa  146  8.000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.46154 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  28.13 
 
 
402 aa  145  9e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0518  cytochrome P450  33.96 
 
 
406 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1763  cytochrome P450  33.54 
 
 
407 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.684418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0530  cytochrome P450  33.96 
 
 
406 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0508  cytochrome P450  33.96 
 
 
406 aa  145  9e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.642311  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>