18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4243 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4243  lipase, putative  100 
 
 		 473 aa  956    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.48059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2050  hypothetical protein  48.75 
 
 		 436 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.171938  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1275  acetyltransferase and hydrolase with the alpha/beta hydrolase fold-like protein  43.42 
 
 		 448 aa  338  9e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.676872  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1272  hypothetical protein  27.57 
 
 		 450 aa  94.7  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.136166  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0277  hypothetical protein  25.65 
 
 		 454 aa  80.9  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.854958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0686  twin-arginine translocation pathway signal  25.86 
 
 		 475 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.952242 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0117  twin-arginine translocation pathway signal  25.06 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3906  lipase class 2  36.44 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.301262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0764  lipase, class 2  37.19 
 
 		 222 aa  67  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6471  lipase class 2  35.66 
 
 		 223 aa  60.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0409022 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0706  lipase class 2  34.29 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.103882  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2086  lipase class 2  33.33 
 
 		 225 aa  50.8  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.638373  normal  0.507521 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3564  lipase class 2  34.12 
 
 		 222 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0545934  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  26.67 
 
 		 273 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3837  hypothetical protein  25.21 
 
 		 455 aa  44.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1006  lactonizing lipase  35.14 
 
 		 339 aa  44.3  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.169122  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5050  alpha/beta hydrolase fold  26.44 
 
 		 243 aa  43.5  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1839  hypothetical protein  28.41 
 
 		 246 aa  43.1  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.028666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>