37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3875 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3875  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
287 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0850  fatty acid hydroxylase  71.16 
 
 
250 aa  308  5e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0804636  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4487  fatty acid hydroxylase  38.65 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7455  fatty acid hydroxylase  39.22 
 
 
252 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084393  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2728  fatty acid hydroxylase  41.15 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32022  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2772  fatty acid hydroxylase  41.15 
 
 
224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.626718  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2758  fatty acid hydroxylase  41.15 
 
 
224 aa  129  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.85391  normal  0.349911 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2943  fatty acid hydroxylase  37.56 
 
 
221 aa  120  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0010  fatty acid hydroxylase  36.89 
 
 
246 aa  103  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1521  fatty acid hydroxylase  27.92 
 
 
209 aa  82  0.00000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1724  fatty acid hydroxylase-like protein  32.21 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0138554  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1775  fatty acid hydroxylase-like protein  32.26 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.267446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1478  fatty acid hydroxylase FAH1P  32.26 
 
 
209 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1701  fatty acid hydroxylase-like protein  30.06 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3674  fatty acid hydroxylase-like protein  31.01 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.236693  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1488  fatty acid hydroxylase FAH1P  30.06 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00473725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1516  fatty acid hydroxylase-like protein  30.06 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.567618  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1633  fatty acid hydroxylase-like protein  30.06 
 
 
209 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1670  fatty acid hydroxylase-like protein  30.38 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5647  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.220259 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33435  predicted protein  29.51 
 
 
265 aa  69.3  0.00000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0011  fatty acid hydroxylase  25.83 
 
 
209 aa  63.9  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3907  fatty acid hydroxylase  28.22 
 
 
276 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.544374  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4993  fatty acid hydroxylase  48.53 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.655235  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0498  fatty acid hydroxylase  26.67 
 
 
220 aa  53.9  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3415  fatty acid hydroxylase  29.41 
 
 
260 aa  53.9  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2546  fatty acid hydroxylase  23.18 
 
 
210 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.785784 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00918  conserved hypothetical protein similar to alpha-hydroxylase Scs7 (Eurofung)  28.47 
 
 
369 aa  46.6  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.191314  normal  0.2338 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3482  fatty acid hydroxylase  26.53 
 
 
215 aa  45.8  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0449  fatty acid hydroxylase  28.18 
 
 
235 aa  45.8  0.0007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0106525  normal  0.0715856 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00680  oxidoreductase, putative  30.99 
 
 
490 aa  46.2  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4535  carotene hydroxylase  27.48 
 
 
168 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  31.76 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2405  fatty acid hydroxylase  25 
 
 
206 aa  43.9  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0585006  normal  0.477297 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42944  predicted protein  28.19 
 
 
376 aa  43.5  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.35804  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2669  hypothetical protein  32.21 
 
 
235 aa  43.1  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110076  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  31.76 
 
 
235 aa  42.7  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>