28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2854 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
235 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  98.72 
 
 
235 aa  455  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2669  hypothetical protein  92.34 
 
 
235 aa  424  1e-118  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110076  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  68.89 
 
 
228 aa  306  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  37 
 
 
369 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3702  fatty acid hydroxylase  32.08 
 
 
279 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  34.09 
 
 
371 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  34.09 
 
 
371 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  34.09 
 
 
371 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  33.96 
 
 
367 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  36.04 
 
 
381 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  33.96 
 
 
367 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  33.96 
 
 
367 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  33.96 
 
 
367 aa  116  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  34.09 
 
 
371 aa  113  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2399  fatty acid hydroxylase  35.29 
 
 
223 aa  112  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2974  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3184  hypothetical protein  36.89 
 
 
376 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0636163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  35.65 
 
 
378 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8057  putative membrane protein with short-chain dehydrogenase/reductase  28.5 
 
 
263 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  31.63 
 
 
272 aa  96.7  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0787  hypothetical protein  29.03 
 
 
271 aa  94.7  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399793  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3325  hypothetical protein  31.63 
 
 
277 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.038125  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0010  fatty acid hydroxylase  29.86 
 
 
246 aa  49.3  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2943  fatty acid hydroxylase  29.91 
 
 
221 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2772  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.626718  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2728  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32022  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7455  fatty acid hydroxylase  28.1 
 
 
252 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.084393  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3875  fatty acid hydroxylase  31.76 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>