23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3702 on replicon NC_009955
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009955  Dshi_3702  fatty acid hydroxylase  100 
 
 		 279 aa  579  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8057  putative membrane protein with short-chain dehydrogenase/reductase  40.08 
 
 		 263 aa  202  6e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3325  hypothetical protein  40 
 
 		 277 aa  180  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.038125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0787  hypothetical protein  36.97 
 
 		 271 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  37.82 
 
 		 272 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2669  hypothetical protein  33.02 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  32.55 
 
 		 235 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  32.08 
 
 		 235 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  35.44 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  32.11 
 
 		 369 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  32.21 
 
 		 371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  35.94 
 
 		 381 aa  113  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 367 aa  113  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  32.85 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  32.85 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  32.85 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  32.85 
 
 		 371 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3184  hypothetical protein  34.95 
 
 		 376 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0636163  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  33.49 
 
 		 228 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2399  fatty acid hydroxylase  32.49 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2974  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1979  fatty acid hydroxylase  26.27 
 
 		 240 aa  47.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.919937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>