23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2399 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2399  fatty acid hydroxylase  100 
 
 
223 aa  456  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2974  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  37.32 
 
 
228 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2669  hypothetical protein  37.17 
 
 
235 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  35.57 
 
 
235 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  35.57 
 
 
235 aa  118  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8057  putative membrane protein with short-chain dehydrogenase/reductase  36.74 
 
 
263 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  35.38 
 
 
367 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  35.38 
 
 
367 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0787  hypothetical protein  32.23 
 
 
271 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399793  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  35.38 
 
 
367 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  35.38 
 
 
367 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  35.38 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  35.38 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  35.45 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  35.38 
 
 
371 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  33.49 
 
 
272 aa  113  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  34.88 
 
 
369 aa  108  5e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  34.93 
 
 
381 aa  105  8e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3325  hypothetical protein  30.23 
 
 
277 aa  103  3e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.038125  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3184  hypothetical protein  36.11 
 
 
376 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0636163  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  35.65 
 
 
378 aa  102  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3702  fatty acid hydroxylase  33.17 
 
 
279 aa  100  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3005  fatty acid hydroxylase  25.21 
 
 
269 aa  42.4  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>