26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0787 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0787  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  568  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  73.98 
 
 		 272 aa  427  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3325  hypothetical protein  65.44 
 
 		 277 aa  383  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.038125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8057  putative membrane protein with short-chain dehydrogenase/reductase  47.9 
 
 		 263 aa  241  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3702  fatty acid hydroxylase  36.97 
 
 		 279 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  31.92 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3184  hypothetical protein  31.92 
 
 		 376 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0636163  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  33.64 
 
 		 381 aa  112  9e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  30.52 
 
 		 371 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  29.05 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  29.11 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  29.11 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  29.11 
 
 		 371 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  29.13 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  29.13 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  29.13 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  29.13 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2399  fatty acid hydroxylase  31.1 
 
 		 223 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2974  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2669  hypothetical protein  30.73 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  29.03 
 
 		 235 aa  96.3  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  27.88 
 
 		 228 aa  95.9  7e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  29.03 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4487  fatty acid hydroxylase  25.52 
 
 		 244 aa  48.9  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2943  fatty acid hydroxylase  28.57 
 
 		 221 aa  43.9  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0607383  normal  0.39522 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2772  fatty acid hydroxylase  24.88 
 
 		 224 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.626718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2728  fatty acid hydroxylase  24.88 
 
 		 224 aa  42  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.32022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>