23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3325 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_3325  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  578  1e-164  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.038125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0787  hypothetical protein  65.44 
 
 		 271 aa  383  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2889  fatty acid hydroxylase  63.43 
 
 		 272 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00520579  normal  0.0784368 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8057  putative membrane protein with short-chain dehydrogenase/reductase  45.45 
 
 		 263 aa  228  9e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3702  fatty acid hydroxylase  40 
 
 		 279 aa  180  2.9999999999999997e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2669  hypothetical protein  31.28 
 
 		 235 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.110076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3129  Fatty acid hydroxylase  31.05 
 
 		 381 aa  99.8  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2307  hypothetical protein  29.61 
 
 		 371 aa  97.1  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1413  hypothetical protein  29.13 
 
 		 371 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2308  putative lipoprotein  29.13 
 
 		 367 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3072  hypothetical protein  29.13 
 
 		 371 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3199  putative lipoprotein  29.13 
 
 		 367 aa  96.7  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.160296  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1328  putative lipoprotein  29.13 
 
 		 367 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1041  hypothetical protein  29.13 
 
 		 367 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.117784  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2018  hypothetical protein  29.13 
 
 		 371 aa  96.7  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0975  hypothetical protein  26.89 
 
 		 369 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.727204  normal  0.153799 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37130  hypothetical protein  31.13 
 
 		 378 aa  95.9  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000362882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2760  fatty acid hydroxylase  30.33 
 
 		 235 aa  95.5  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3184  hypothetical protein  31.6 
 
 		 376 aa  94  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0636163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2854  fatty acid hydroxylase  30.33 
 
 		 235 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000286921  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2399  fatty acid hydroxylase  29.72 
 
 		 223 aa  93.6  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.2974  normal  0.582775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2648  hypothetical protein  27.88 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.437546  normal  0.57129 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4487  fatty acid hydroxylase  25.5 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>