More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3709 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1669  H(+)-transporting two-sector ATPase  70.44 
 
 		 549 aa  796    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1070  ATP synthase F1, alpha subunit  71.59 
 
 		 542 aa  759    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1125  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.3 
 
 		 543 aa  703    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.826073  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1919  ATP synthase F1, alpha subunit  67.77 
 
 		 542 aa  744    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.086846  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3864  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.25 
 
 		 548 aa  753    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283904  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2409  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.21 
 
 		 547 aa  800    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.59 
 
 		 550 aa  782    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000699734 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2450  ATP synthase F1, alpha subunit  71.84 
 
 		 543 aa  759    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6138  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.29 
 
 		 548 aa  778    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08160  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.96 
 
 		 555 aa  744    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2340  F0F1 ATP synthase subunit alpha  67.47 
 
 		 545 aa  740    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125145 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4138  ATP synthase F1, alpha subunit  70.33 
 
 		 545 aa  779    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.413993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1314  ATP synthase F1 subunit alpha  68.27 
 
 		 545 aa  741    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1216  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.27 
 
 		 544 aa  803    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.24 
 
 		 544 aa  754    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.206364  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0898  ATP synthase F1 subunit alpha  72.51 
 
 		 549 aa  809    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1253  ATP synthase F1, alpha subunit  67.22 
 
 		 544 aa  734    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0274043  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3709  F0F1 ATP synthase subunit alpha  100 
 
 		 552 aa  1112    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2316  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.31 
 
 		 548 aa  754    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1022  F0F1 ATP synthase subunit alpha  89.32 
 
 		 553 aa  989    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4330  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.03 
 
 		 548 aa  757    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930948  normal  0.0279627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1761  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.5 
 
 		 547 aa  763    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.743322  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0146  ATP synthase F1, alpha subunit  65.28 
 
 		 553 aa  724    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.445327 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3952  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.25 
 
 		 548 aa  753    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0936185  hitchhiker  0.00501194 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29570  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.61 
 
 		 548 aa  761    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3632  F0F1 ATP synthase subunit alpha  72.4 
 
 		 550 aa  776    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.145338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3878  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.25 
 
 		 548 aa  753    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2124  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.98 
 
 		 547 aa  763    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00337947  hitchhiker  0.00781719 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18220  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.19 
 
 		 549 aa  786    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.850315  normal  0.256257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19150  F0F1 ATP synthase subunit alpha  68.83 
 
 		 541 aa  753    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0334  ATP synthase F1, alpha subunit  71.27 
 
 		 546 aa  779    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.297297 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1776  F0F1 ATP synthase subunit alpha  70.99 
 
 		 543 aa  746    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.984214 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1268  F0F1 ATP synthase subunit alpha  69.34 
 
 		 552 aa  760    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.186201 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2607  F0F1 ATP synthase subunit alpha  66.97 
 
 		 545 aa  738    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197618  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11335  F0F1 ATP synthase subunit alpha  71.13 
 
 		 549 aa  757    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0651  F0F1 ATP synthase subunit alpha  75.69 
 
 		 554 aa  838    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.310941  normal  0.421508 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3918  ATP synthase F1, alpha subunit  72.91 
 
 		 546 aa  801    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10010  ATP synthase F1 subcomplex alpha subunit  72.94 
 
 		 543 aa  770    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.564506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1797  ATP synthase F1, alpha subunit  62.48 
 
 		 504 aa  624  1e-178  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2759  ATP synthase F1, alpha subunit  60.12 
 
 		 502 aa  622  1e-177  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2829  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.92 
 
 		 502 aa  611  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3417  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.57 
 
 		 502 aa  605  9.999999999999999e-173  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1711  F0F1 ATP synthase subunit alpha  60.43 
 
 		 503 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2193  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.35 
 
 		 502 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1014  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.33 
 
 		 502 aa  603  1.0000000000000001e-171  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000116673  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2584  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.59 
 
 		 505 aa  602  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.341955  normal  0.818927 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3305  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.98 
 
 		 502 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.694138  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0621  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.55 
 
 		 509 aa  598  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0065  ATP synthase F1, alpha subunit  58.72 
 
 		 508 aa  598  1e-170  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2214  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.94 
 
 		 504 aa  601  1e-170  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.188551  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1492  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.74 
 
 		 505 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0642798  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5432  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1426  ATP synthase F1, alpha subunit  57.03 
 
 		 507 aa  596  1e-169  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5157  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4990  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5007  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5398  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2629899999999999e-45 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2141  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.45 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.588965  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5105  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  595  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17820  ATP synthase F1, alpha subunit  56.56 
 
 		 541 aa  595  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5429  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.099904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3408  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.83 
 
 		 503 aa  595  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5549  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.31478  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1463  ATP synthase F1, alpha subunit  58.55 
 
 		 509 aa  597  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.298107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5485  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.184326  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.45 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3827  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  597  1e-169  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5522  F0F1 ATP synthase subunit alpha  59.06 
 
 		 502 aa  596  1e-169  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000300598  hitchhiker  0.0000000000000322299 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0111  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.25 
 
 		 503 aa  592  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2846  ATP synthase F1, alpha subunit  57.56 
 
 		 508 aa  592  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.525611 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4167  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.15 
 
 		 501 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0685  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.56 
 
 		 505 aa  592  1e-168  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.17328  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0987  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.06 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0975811  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1620  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.71 
 
 		 504 aa  593  1e-168  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0802007  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2186  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.24 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0663  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57 
 
 		 520 aa  592  1e-168  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0131395  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4261  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.43 
 
 		 502 aa  592  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00501837  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0270  F0F1 ATP synthase subunit alpha  55.56 
 
 		 505 aa  589  1e-167  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1275  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.84 
 
 		 503 aa  590  1e-167  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.588856  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1179  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.84 
 
 		 503 aa  590  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.244084  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2380  ATP synthase F1, alpha subunit  59.18 
 
 		 507 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0176105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4793  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.96 
 
 		 502 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2606  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.67 
 
 		 506 aa  588  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3152  ATP synthase F1, alpha subunit  58.94 
 
 		 501 aa  589  1e-167  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1519  ATP synthase F1, alpha subunit  56.53 
 
 		 512 aa  588  1e-167  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.283334  hitchhiker  0.000000000000106657 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0519  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.27 
 
 		 501 aa  590  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0861  F0F1 ATP synthase subunit alpha  58.07 
 
 		 501 aa  586  1e-166  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0205389  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0173  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.25 
 
 		 510 aa  586  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2286  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.58 
 
 		 509 aa  587  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1043  ATP synthase F1, alpha subunit  57.44 
 
 		 522 aa  588  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.890996  normal  0.113061 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3383  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.39 
 
 		 503 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0111242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2199  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.03 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.539772 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3738  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.27 
 
 		 502 aa  587  1e-166  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1240  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.09 
 
 		 506 aa  587  1e-166  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1871  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.5 
 
 		 505 aa  588  1e-166  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.798226  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1527  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.08 
 
 		 505 aa  587  1e-166  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000683533  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2720  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.39 
 
 		 503 aa  588  1e-166  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2078  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.37 
 
 		 509 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.368934 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1679  F0F1 ATP synthase subunit alpha  56.34 
 
 		 510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.536422  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0267  F0F1 ATP synthase subunit alpha  57.06 
 
 		 510 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.686525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>