More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2872 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6477  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  70.1 
 
 		 511 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140482  normal  0.0817062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2374  aldehyde dehydrogenase  74.55 
 
 		 533 aa  742    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.238793 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2872  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  100 
 
 		 561 aa  1114    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.102568  normal  0.763851 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2176  aldehyde dehydrogenase  66.99 
 
 		 501 aa  626  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2925  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  60.94 
 
 		 530 aa  620  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.739549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2249  Aldehyde Dehydrogenase  63.39 
 
 		 529 aa  602  1.0000000000000001e-171  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408136  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1373  Aldehyde Dehydrogenase  47.53 
 
 		 529 aa  425  1e-117  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.586199 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2080  Aldehyde Dehydrogenase  45.59 
 
 		 530 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.319656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  41.7 
 
 		 493 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  39.06 
 
 		 498 aa  360  3e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  39.84 
 
 		 499 aa  359  6e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  41.96 
 
 		 516 aa  351  2e-95  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  42.01 
 
 		 496 aa  349  6e-95  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  39.6 
 
 		 493 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  39.73 
 
 		 500 aa  343  4e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  39.49 
 
 		 503 aa  342  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  39.29 
 
 		 497 aa  341  2e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  37.89 
 
 		 493 aa  340  5e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  39.26 
 
 		 498 aa  334  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3867  aldehyde dehydrogenase  39.61 
 
 		 498 aa  323  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3314  aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 		 496 aa  323  6e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  36.4 
 
 		 505 aa  304  3.0000000000000004e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  37.35 
 
 		 496 aa  301  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1357  betaine-aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 		 480 aa  277  4e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.368184  normal  0.825895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1643  aldehyde dehydrogenase  41.54 
 
 		 514 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1287  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  41.46 
 
 		 529 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.195154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1270  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  41.46 
 
 		 529 aa  260  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1935  Aldehyde Dehydrogenase  40.73 
 
 		 515 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4799  aldehyde dehydrogenase  40.22 
 
 		 513 aa  260  6e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.228606  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02148  putative transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  39.21 
 
 		 504 aa  259  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5803  Aldehyde Dehydrogenase  35.74 
 
 		 480 aa  257  4e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.164732  normal  0.396611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5258  aldehyde dehydrogenase family protein  37.97 
 
 		 496 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0956812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3747  aldehyde dehydrogenase  35.21 
 
 		 478 aa  256  7e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5168  aldehyde dehydrogenase  37.97 
 
 		 496 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.545651  normal  0.0529953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1418  betaine-aldehyde dehydrogenase  36.72 
 
 		 477 aa  256  9e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00255167  normal  0.0518765 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0213  aldehyde dehydrogenase  37.97 
 
 		 496 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.225819  normal  0.287254 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5802  aldehyde dehydrogenase  34.98 
 
 		 480 aa  255  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1297  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  40.04 
 
 		 530 aa  254  3e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.224438 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5310  aldehyde dehydrogenase  37.97 
 
 		 496 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.09139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0895  aldehyde dehydrogenase  36.13 
 
 		 496 aa  254  3e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51050  aldehyde dehydrogenase  38.92 
 
 		 529 aa  254  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.790236  hitchhiker  0.000000280962 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3110  aldehyde dehydrogenase  37.18 
 
 		 503 aa  253  7e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0859  Aldehyde Dehydrogenase  34.54 
 
 		 478 aa  251  3e-65  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3514  aldehyde dehydrogenase  36.9 
 
 		 496 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4477  aldehyde dehydrogenase  34.83 
 
 		 498 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.749064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.76 
 
 		 479 aa  247  4e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2952  aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 		 494 aa  246  6e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1292  putative aldehyde dehydrogenase  39.26 
 
 		 494 aa  246  8e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4431  Aldehyde Dehydrogenase  34.96 
 
 		 483 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0589221  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5270  aldehyde dehydrogenase  37.06 
 
 		 571 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.295049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0212  Aldehyde Dehydrogenase  33.89 
 
 		 484 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13322  piperideine-6-carboxilic acid dehydrogenase pcd  39.14 
 
 		 494 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3097  aldehyde dehydrogenase  37.06 
 
 		 503 aa  244  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4998  aldehyde dehydrogenase  37.06 
 
 		 503 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1710  aldehyde dehydrogenase  35.12 
 
 		 513 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2725  aldehyde dehydrogenase  37.65 
 
 		 494 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0380  aldehyde dehydrogenase  37.6 
 
 		 503 aa  243  5e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2240  Aldehyde Dehydrogenase  36.08 
 
 		 482 aa  243  5e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.455066  normal  0.336013 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  34.36 
 
 		 479 aa  243  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1891  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  36.51 
 
 		 496 aa  242  1e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1304  hypothetical protein  33.14 
 
 		 506 aa  242  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4356  aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 497 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.203808  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3171  Aldehyde Dehydrogenase  35.14 
 
 		 477 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.427314  normal  0.922652 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2080  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.73 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1983  putative piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.73 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.467397  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1305  hypothetical protein  33.14 
 
 		 506 aa  242  2e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0495  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.73 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0495  Aldehyde Dehydrogenase  36.4 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2827  succinate semialdehyde dehydrogenase  35.84 
 
 		 483 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8483  Aldehyde Dehydrogenase  37.48 
 
 		 522 aa  241  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37507  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2910  Aldehyde Dehydrogenase  34.3 
 
 		 477 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0678  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.73 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.808953  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2418  Aldehyde Dehydrogenase  34.75 
 
 		 509 aa  242  2e-62  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.354297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0544  aldehyde dehydrogenase  33.81 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.292442  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0566  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.73 
 
 		 535 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0745334  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0779  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.73 
 
 		 503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0381383  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0577  aldehyde dehydrogenase  34.5 
 
 		 483 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1631  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.73 
 
 		 503 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3627  aldehyde dehydrogenase  37.99 
 
 		 503 aa  239  6.999999999999999e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.225192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3954  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.65 
 
 		 481 aa  239  8e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0655928  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0285  aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 		 506 aa  239  9e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.297745  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0277  aldehyde dehydrogenase  33.75 
 
 		 477 aa  239  1e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.872601  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4630  aldehyde dehydrogenase  36.86 
 
 		 503 aa  238  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4209  Aldehyde Dehydrogenase  33.94 
 
 		 483 aa  238  2e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3974  aldehyde dehydrogenase  35.26 
 
 		 475 aa  238  2e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3681  Aldehyde Dehydrogenase  35.06 
 
 		 509 aa  238  2e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.160701 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5160  aldehyde dehydrogenase  36.77 
 
 		 503 aa  238  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.447339 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0898  piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  38.93 
 
 		 503 aa  238  3e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3159  aldehyde dehydrogenase  35.84 
 
 		 510 aa  237  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.510599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2411  aldehyde dehydrogenase  37.32 
 
 		 516 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1249  putative aldehyde dehydrogenase  37.64 
 
 		 517 aa  237  4e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.586964  normal  0.195396 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6141  aldehyde dehydrogenase  35.75 
 
 		 446 aa  237  4e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42872  predicted protein  37.17 
 
 		 503 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.701812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1126  aldehyde dehydrogenase  35.44 
 
 		 485 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.393989 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0053  NAD+-dependent aldehyde dehydrogenase  34.19 
 
 		 513 aa  237  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00294744 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  31.85 
 
 		 483 aa  236  6e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04370  delta-1-piperideine-6-carboxylate dehydrogenase  36.2 
 
 		 502 aa  236  6e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0694384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2515  aldehyde dehydrogenase  35.46 
 
 		 502 aa  236  7e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  31.64 
 
 		 483 aa  236  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1046  Aldehyde Dehydrogenase  35.23 
 
 		 485 aa  236  1.0000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>