236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1573 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1573  glycosyl transferase family protein  100 
 
 		 323 aa  644    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.169867 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6545  glycosyl transferase family protein  61.35 
 
 		 293 aa  322  8e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.125421 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0757  glycosyl transferase family protein  60.29 
 
 		 307 aa  281  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  hitchhiker  0.00627267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8510  glycosyl transferase family 2  38.89 
 
 		 286 aa  152  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0292973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4051  WecB/TagA/CpsF family glycosyl transferase  40.78 
 
 		 884 aa  149  5e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4488  glycosyl transferase family 2  37.1 
 
 		 273 aa  142  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0652  cell wall biogenesis glycosyltransferase-like protein  36.81 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2691  glycosyl transferase, family 2  37.06 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.155686  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3908  glycosyl transferase, WecB/TagA/CpsF family  33.57 
 
 		 907 aa  122  7e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2406  glycosyl transferase family protein  40.53 
 
 		 280 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0844  glycosyl transferase family protein  35.45 
 
 		 275 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.363473  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1942  glycosyl transferase family protein  34.7 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4777  glycosyl transferase family 2  37.61 
 
 		 393 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.340207 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4195  glycosyl transferase family 2  37.38 
 
 		 345 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.859941 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0453  LmbE-like protein  35.16 
 
 		 693 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2958  glycosyl transferase family 2  44.71 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2016  glycosyl transferase family protein  29.17 
 
 		 378 aa  57.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1742  glycosyltransferase  42.39 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00465779  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  35.87 
 
 		 403 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1530  glycosyltransferase  36.62 
 
 		 694 aa  55.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2368  glycosyl transferase family protein  27.17 
 
 		 378 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  37.5 
 
 		 752 aa  54.3  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2158  glycosyltransferase  28.67 
 
 		 452 aa  53.9  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3499  glycosyl transferase family 2  37.9 
 
 		 497 aa  54.3  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.802267  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3023  polysaccharide deacetylase  34.02 
 
 		 1120 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4887  family 2 glycosyl transferase  33.33 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  38.14 
 
 		 428 aa  52.8  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1910  glycosyl transferase family 2  31.97 
 
 		 622 aa  52.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00799183  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  42.47 
 
 		 358 aa  52.4  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3023  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.82 
 
 		 505 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4464  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05330  Glycosyl transferase, family 2  30.81 
 
 		 383 aa  51.6  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0200039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  34.48 
 
 		 415 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3975  polysaccharide pyruvyl transferase  33.94 
 
 		 1225 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.584875 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2811  glycosyl transferase family 2  31.48 
 
 		 307 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.104457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5289  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 		 403 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2046  glycosyl transferase family 2  35.29 
 
 		 549 aa  50.4  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.421423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2044  glycosyl transferase family 2  32.93 
 
 		 230 aa  50.4  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.462866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1549  glycosyl transferase family protein  38.61 
 
 		 240 aa  50.4  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  0.851188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0425  glycosyl transferase family protein  28.69 
 
 		 514 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0423  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.64 
 
 		 518 aa  49.7  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3947  glycosyl transferase family 2  25.31 
 
 		 445 aa  49.7  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2017  glycosyl transferase family protein  35.19 
 
 		 322 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0480  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.64 
 
 		 518 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0793  glycosyl transferase family 2  38.95 
 
 		 390 aa  49.3  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.568999  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3822  glycosyl transferase family 2  27.44 
 
 		 271 aa  49.3  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0508  group 2 family glycosyl transferase  27.64 
 
 		 514 aa  49.3  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.880762  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1393  glycosyl transferase family protein  28.76 
 
 		 395 aa  49.3  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0519554  hitchhiker  0.000418344 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1188  glycosyl transferase family 2  36.94 
 
 		 606 aa  49.3  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.017563  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3442  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.9 
 
 		 253 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.184184  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3228  glycosyl transferase, group 2 family protein/polysaccharide deacetylase family protein  35.14 
 
 		 927 aa  48.5  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.80947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06620  glycosyl transferase family 2  29.52 
 
 		 221 aa  48.9  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.74936e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0419  cell wall biogenesis glycosyltransferase  27.64 
 
 		 518 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0489  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.64 
 
 		 514 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0511  glycosyl transferase, group 2 family protein  27.97 
 
 		 518 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02310  glycosyl transferase  38.1 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03040  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.67 
 
 		 231 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1525  glycosyl transferase family protein  38.24 
 
 		 240 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  23.81 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3473  glycosyl transferase family 2  32.56 
 
 		 228 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.552524 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3307  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 		 544 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.432845 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1627  glycosyl transferase family protein  29.29 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0667673  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4143  glycosyl transferase family protein  35.92 
 
 		 291 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.89997 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1868  glycosyl transferase family protein  31.25 
 
 		 503 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.790321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2813  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.95 
 
 		 505 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.188674  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2761  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.95 
 
 		 505 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.022038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2744  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.95 
 
 		 505 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.613025  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0071  glycosyl transferase family 2  25.89 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4812  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.46 
 
 		 514 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2064  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 		 322 aa  48.5  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.346015  normal  0.195007 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3458  group-specific protein  33.78 
 
 		 872 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3026  group 2 family glycosyl transferase  28.95 
 
 		 505 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.284753  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2686  glycosyl transferase family 2  31.19 
 
 		 327 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.81891  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  27.27 
 
 		 289 aa  47.8  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3021  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.95 
 
 		 505 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1913  glycosyl transferase family 2  42.11 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1105  glycosyl transferase family protein  32 
 
 		 632 aa  48.5  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.293938  normal  0.766721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4796  glycosyl transferase family 2  48.33 
 
 		 495 aa  48.1  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3738  glycosyl transferase family 2  32.73 
 
 		 279 aa  48.1  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.924645  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1438  glycosyl transferase family 2  27.64 
 
 		 213 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.192606  normal  0.0852028 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1239  cell wall membrane glycosyltransferase  33.71 
 
 		 344 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16631  glycosyl transferase family protein  34.26 
 
 		 314 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.505772 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  39.44 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1988  glycosyl transferase family 2  26.15 
 
 		 445 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0862  glycosyl transferase family protein  36.54 
 
 		 291 aa  47.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3745  glycosyl transferase family 2  29.07 
 
 		 226 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1235  sugar transferase  32.88 
 
 		 341 aa  47.8  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3275  glycosyl transferase family 2  35.56 
 
 		 509 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1776  glycosyl transferase family 2  32.61 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0562  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.83 
 
 		 524 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3138  glycosyltransferase  28.57 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259725  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3948  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 		 471 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1618  glycosyl transferase family protein  25.77 
 
 		 304 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0763689  normal  0.102871 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0564  glycosyl transferase, group 2 family protein  26.83 
 
 		 514 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3028  glycosyl transferase family protein  35.23 
 
 		 704 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9270  glycosyltransferase-like protein  43.28 
 
 		 243 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.444008 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2471  glycosyl transferase family 2  34.09 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3434  glycosyl transferase, group 2 family protein  42.86 
 
 		 253 aa  47  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5268  glycosyl transferase family 2  39.77 
 
 		 386 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0548  glycosyl transferase family protein  31.52 
 
 		 1002 aa  47.4  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>