37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0960 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0960  hypothetical protein  100 
 
 		 282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1122  transposase  82.74 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  82.74 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  82.74 
 
 		 277 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6762  transposase IS4 family protein  81.86 
 
 		 277 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2771  transposase IS4 family protein  81.86 
 
 		 277 aa  378  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2996  transposase IS4 family protein  81.42 
 
 		 277 aa  375  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5748  transposase IS4 family protein  81.42 
 
 		 277 aa  373  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.970516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2963  transposase IS4 family protein  80.53 
 
 		 277 aa  369  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0248  transposase  59.81 
 
 		 211 aa  237  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3548  transposase IS4 family protein  48.61 
 
 		 292 aa  175  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0747945  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3531  transposase IS4 family protein  47.06 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3449  transposase IS4 family protein  47.06 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2917  transposase IS4 family protein  47.06 
 
 		 269 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2974  transposase IS4 family protein  46.7 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4217  transposase, IS4  70.1 
 
 		 188 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.829185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0696  transposase IS4 family protein  55.15 
 
 		 269 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4215  hypothetical protein  69.31 
 
 		 122 aa  117  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  36.75 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  36.75 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  36.75 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  36.75 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  36.75 
 
 		 280 aa  95.5  9e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  33 
 
 		 260 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0963  hypothetical protein  35.68 
 
 		 326 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  30.1 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  30.1 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 257 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  31.9 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  33 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  32.24 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  29.52 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  33.33 
 
 		 274 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  35.26 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>