18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0655 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0655  hypothetical protein  100 
 
 		 181 aa  358  3e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.143096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5975  hypothetical protein  68.1 
 
 		 228 aa  164  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.718615  normal  0.151599 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0564  hypothetical protein  51.92 
 
 		 554 aa  99.4  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.19709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3993  hypothetical protein  33.94 
 
 		 346 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.522345  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3995  hypothetical protein  33.33 
 
 		 535 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2638  hypothetical protein  33.87 
 
 		 526 aa  55.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316802  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2802  hypothetical protein  36.45 
 
 		 537 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1817  hypothetical protein  33.33 
 
 		 527 aa  54.7  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2378  hypothetical protein  34.91 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2626  hypothetical protein  33.94 
 
 		 519 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0163  hypothetical protein  33.93 
 
 		 505 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2840  hypothetical protein  34.26 
 
 		 503 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.43612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2698  hypothetical protein  33.64 
 
 		 514 aa  48.1  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.570232 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4245  hypothetical protein  28.67 
 
 		 316 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1829  hypothetical protein  32.69 
 
 		 519 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.790785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1827  hypothetical protein  32.69 
 
 		 484 aa  47  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0051  hypothetical protein  38.83 
 
 		 565 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0401  hypothetical protein  35.09 
 
 		 181 aa  42  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>