34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1584 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_1584  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 376 aa  727    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.315598  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0382  ABC-2 type transporter  34.33 
 
 		 365 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1716  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 366 aa  153  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1643  ABC-2 type transporter  28.95 
 
 		 366 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1411  ABC-2 type transporter  23.48 
 
 		 391 aa  86.7  7e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3252  ABC-2 type transporter  23.56 
 
 		 375 aa  55.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.432582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3461  hypothetical protein  23.51 
 
 		 369 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  21.39 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3002  ABC-2 type transporter  23.26 
 
 		 375 aa  50.8  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.871422 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  23.93 
 
 		 380 aa  49.7  0.00009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  22.48 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1478  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 375 aa  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1268  multidrug ABC transporter permease component  21.67 
 
 		 372 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0273495  normal  0.0243743 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0851  inner membrane transport permease YbhS  21.2 
 
 		 376 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  24.81 
 
 		 415 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1017  ABC-2 type transporter  21.1 
 
 		 372 aa  45.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  22.49 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  24.41 
 
 		 376 aa  44.3  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 366 aa  44.3  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  24.65 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.29 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  24.65 
 
 		 368 aa  44.3  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0879  inner membrane transport permease YbhS  20.94 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.585114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0943  inner membrane transport permease YbhS  20.94 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0964  inner membrane transport permease YbhS  20.94 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  21.71 
 
 		 370 aa  43.9  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0911  inner membrane transport permease YbhS  20.94 
 
 		 376 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  24.29 
 
 		 374 aa  44.3  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  24.59 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  20.53 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1284  ABC-2 type transporter  20.54 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  24.28 
 
 		 356 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8102  ABC-2 type transporter  21.85 
 
 		 379 aa  42.7  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  19.44 
 
 		 366 aa  42.7  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>