More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0828 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0828  uridylate kinase  100 
 
 		 234 aa  469  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0482  uridylate kinase  75.54 
 
 		 233 aa  366  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1721  uridylate kinase  63.04 
 
 		 232 aa  306  2.0000000000000002e-82  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1188  uridylate kinase  57.64 
 
 		 231 aa  274  8e-73  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153255  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1267  uridylate kinase  57.21 
 
 		 231 aa  271  4.0000000000000004e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.761618  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0215  uridylate kinase  48.5 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  47.84 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0078  uridylate kinase  42.49 
 
 		 236 aa  201  8e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000395488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0569  uridylate kinase  44.3 
 
 		 239 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0199156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1495  uridylate kinase  44.26 
 
 		 245 aa  201  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  42.8 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  42.8 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1452  uridylate kinase  43.35 
 
 		 246 aa  198  7.999999999999999e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.314507  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1263  uridylate kinase  43.4 
 
 		 242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456307 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  43.46 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2601  uridylate kinase  43.72 
 
 		 240 aa  197  2.0000000000000003e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1744  uridylate kinase  44.16 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2351  uridylate kinase  44.16 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.164432  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2693  uridylate kinase  45.11 
 
 		 236 aa  196  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.506156  normal  0.870267 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  45.02 
 
 		 237 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  44.16 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  44.16 
 
 		 237 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1977  uridylate kinase  43.72 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0969376 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  44.59 
 
 		 286 aa  195  6e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01129  uridylate kinase  43.1 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2848  uridylate kinase  43.29 
 
 		 236 aa  194  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.892922 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  194  9e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  43.72 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  42.13 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  42.13 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  42.55 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2008  uridylate kinase  43.72 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1760  uridylate kinase  44.26 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0656922 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  42.86 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  41.7 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0332  uridylate kinase  43.97 
 
 		 243 aa  192  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1842  uridylate kinase  43.48 
 
 		 241 aa  192  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.818163 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1670  uridylate kinase  43.22 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0149338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1814  uridylate kinase  45.85 
 
 		 239 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000487081  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  40.85 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2844  uridylate kinase  45.49 
 
 		 234 aa  192  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000917545  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  43.72 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1991  uridylate kinase  43.29 
 
 		 240 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1808  uridylate kinase  43.4 
 
 		 241 aa  192  5e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.302064 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  42.42 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0659  uridylate kinase  42.42 
 
 		 238 aa  191  7e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1952  uridylate kinase  42.8 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.771793  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2050  uridylate kinase  44.59 
 
 		 237 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  42.86 
 
 		 242 aa  191  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  41.77 
 
 		 246 aa  191  1e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0368  uridylate kinase  43.53 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  45.34 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4946  uridylate kinase  42.86 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723957 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  44.16 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  42.55 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  41.99 
 
 		 244 aa  189  2e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3279  uridylate kinase  41.56 
 
 		 245 aa  189  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00055393  hitchhiker  0.000297429 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3159  uridylate kinase  41.99 
 
 		 245 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000796421  normal  0.227904 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  40.43 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  41.28 
 
 		 234 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2883  uridylate kinase  42.42 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000941193  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1447  uridylate kinase  41.45 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000325029  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1483  uridylate kinase  41.45 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000885565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1556  uridylate kinase  41.13 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249994  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1452  uridylate kinase  41.45 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000689746  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0577  uridylate kinase  43.29 
 
 		 235 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2900  uridylate kinase  41.45 
 
 		 245 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000103165  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  40.69 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  44.16 
 
 		 258 aa  189  4e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  42.13 
 
 		 239 aa  189  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1350  uridylate kinase  41.45 
 
 		 245 aa  189  4e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000001593  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  44.26 
 
 		 240 aa  188  5e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  41.56 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  43.29 
 
 		 245 aa  189  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  45.53 
 
 		 240 aa  188  5.999999999999999e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  42.98 
 
 		 261 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  42.86 
 
 		 235 aa  188  5.999999999999999e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  41.7 
 
 		 242 aa  188  7e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1251  uridylate kinase  41.38 
 
 		 247 aa  188  7e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.313506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  42.8 
 
 		 245 aa  188  7e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  41.28 
 
 		 234 aa  187  9e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1659  uridylate kinase  42.17 
 
 		 237 aa  187  9e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00747686  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  42.42 
 
 		 240 aa  187  9e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  40.68 
 
 		 244 aa  187  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  39.57 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1825  uridylate kinase  42.55 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.537862  normal  0.866362 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  43.72 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  43.72 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2998  uridylate kinase  43.97 
 
 		 240 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>