29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1568 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0134  hypothetical protein  55.56 
 
 
667 aa  790    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0021689  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1568  hypothetical protein  100 
 
 
673 aa  1376    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1597  hypothetical protein  22.38 
 
 
1042 aa  102  2e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.229285  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2363  hypothetical protein  23.2 
 
 
1028 aa  99.4  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.429657 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2901  hypothetical protein  25.09 
 
 
658 aa  97.8  6e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3553  hypothetical protein  23.33 
 
 
672 aa  97.8  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2967  hypothetical protein  20.45 
 
 
673 aa  92.4  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.386459 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3831  hypothetical protein  23.04 
 
 
672 aa  92  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0838  hypothetical protein  20.26 
 
 
704 aa  79.3  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.827538  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5703  transglutaminase domain protein  22.93 
 
 
856 aa  71.2  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.411569  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02460  hypothetical protein  30.09 
 
 
633 aa  64.3  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0828  hypothetical protein  23.17 
 
 
840 aa  62.8  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0727  transglutaminase domain protein  22.77 
 
 
1225 aa  63.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0519  hypothetical protein  25.27 
 
 
1433 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0857  hypothetical protein  20 
 
 
684 aa  61.2  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.121274 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0514  transglutaminase domain protein  24.73 
 
 
1431 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.227327  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2330  hypothetical protein  29.23 
 
 
898 aa  58.2  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.630984  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3645  transglutaminase-like enzyme; cysteine protease  31.39 
 
 
659 aa  54.3  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0486  hypothetical protein  24.59 
 
 
1433 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175307  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0539  hypothetical protein  26.39 
 
 
664 aa  53.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.330242  normal  0.22108 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2485  hypothetical protein  25.82 
 
 
647 aa  48.5  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1886  hypothetical protein  23.16 
 
 
637 aa  48.5  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3005  TPR repeat-containing protein  25.81 
 
 
1096 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000321187 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4803  hypothetical protein  37.7 
 
 
342 aa  47.8  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.984795  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3320  hypothetical protein  25.9 
 
 
616 aa  47  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.399338  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0259  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.42 
 
 
1256 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.690261  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0248  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.42 
 
 
1256 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1228  transglutaminase domain protein  25.33 
 
 
1257 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.435864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1934  hypothetical protein  23.3 
 
 
647 aa  44.3  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.279143  normal  0.581278 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>