25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0971 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0558  outer membrane protein  82.68 
 
 
377 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0556  outer membrane protein  82.68 
 
 
377 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0573  outer membrane protein  83.2 
 
 
377 aa  654    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0617  outer membrane protein  82.41 
 
 
377 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0563  outer membrane protein  82.94 
 
 
377 aa  653    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0971  putative outer membrane protein  100 
 
 
381 aa  778    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3398  putative outer membrane protein  80.94 
 
 
383 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26411  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2654  porin  25.2 
 
 
403 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1251  outer membrane porin, putative  30.4 
 
 
402 aa  49.7  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000429036  hitchhiker  0.000137517 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1515  porin  24.48 
 
 
402 aa  49.7  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000337456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  23.55 
 
 
402 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  decreased coverage  0.00000268212 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1821  outer membrane porin, putative  27.13 
 
 
398 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2481  porin  24.37 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000211873  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1654  porin  25.12 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000730706  normal  0.12603 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2723  porin Gram-negative type  24.88 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000866519  hitchhiker  0.00000818773 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1568  porin  24.62 
 
 
403 aa  45.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000403403  hitchhiker  0.00000152354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1620  porin  24.88 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000207941  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1631  porin  24.88 
 
 
403 aa  45.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000133613  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0680  porin  24.68 
 
 
388 aa  44.3  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.424836  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3681  porin  29.84 
 
 
384 aa  43.9  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1474  porin  27.84 
 
 
311 aa  43.5  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  34.34 
 
 
391 aa  43.5  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  26.44 
 
 
357 aa  43.1  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2628  porin  25.6 
 
 
402 aa  43.1  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000106502  hitchhiker  0.00000892589 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3847  porin  23.64 
 
 
354 aa  42.7  0.009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>