12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0558 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0971  putative outer membrane protein  82.68 
 
 		 381 aa  651    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0563  outer membrane protein  99.2 
 
 		 377 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0617  outer membrane protein  98.94 
 
 		 377 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0573  outer membrane protein  99.2 
 
 		 377 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0556  outer membrane protein  99.2 
 
 		 377 aa  759    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0558  outer membrane protein  100 
 
 		 377 aa  765    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3398  putative outer membrane protein  75.2 
 
 		 383 aa  594  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2654  porin  26.32 
 
 		 403 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  28.5 
 
 		 402 aa  50.4  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  decreased coverage  0.00000268212 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4315  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  27.8 
 
 		 357 aa  44.3  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2481  porin  25.36 
 
 		 403 aa  44.3  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000211873  hitchhiker  0.0000558993 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  32.32 
 
 		 391 aa  42.7  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>