16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3398 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009436  Ent638_0971  putative outer membrane protein  80.94 
 
 		 381 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3398  putative outer membrane protein  100 
 
 		 383 aa  778    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.26411  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0573  outer membrane protein  75.72 
 
 		 377 aa  597  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.666146 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0563  outer membrane protein  75.72 
 
 		 377 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.284296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0558  outer membrane protein  75.2 
 
 		 377 aa  594  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.551548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0617  outer membrane protein  74.93 
 
 		 377 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0556  outer membrane protein  75.2 
 
 		 377 aa  593  1e-168  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2654  porin  28.05 
 
 		 403 aa  49.7  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157647  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  34.65 
 
 		 391 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3084  porin  25.37 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  decreased coverage  0.00000268212 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2434  porin  29.69 
 
 		 389 aa  44.3  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.775403  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  26.19 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4558  porin  24.84 
 
 		 360 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1251  outer membrane porin, putative  36.11 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000429036  hitchhiker  0.000137517 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1515  porin  28.79 
 
 		 402 aa  43.1  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000337456  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2283  porin  35.05 
 
 		 385 aa  43.1  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>