63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_R0059 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_R0059  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.442507 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13480  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26520  tRNA-Thr  91.43 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.301685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0043  tRNA-Thr  92.59 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0035  tRNA-Thr  88.41 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0451303  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0001  tRNA-Thr  97.56 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0056  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.74619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0034  tRNA-Thr  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0051  tRNA-Thr  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0040  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000012917  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0090  tRNA-Thr  97.62 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000130806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0033  tRNA-Thr  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.389622  normal  0.782985 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0047  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0026  tRNA-Thr  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.382296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0057  tRNA-Thr  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.133724  normal  0.356392 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0019  tRNA-Thr  94.74 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000126539  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0031  tRNA-Thr  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000818386  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.159115  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0042  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.577114  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0055  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653015  normal  0.0209073 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0038  tRNA-Thr  89.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000295037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0053  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.869905 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0473563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0034  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000100399  hitchhiker  0.00520953 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0088  tRNA-Arg  88.89 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.706466  normal  0.421027 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0035  tRNA-Arg  87.72 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000000581838  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0054  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0017  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0011  tRNA-Ala  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0062  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.768069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0013  tRNA-Thr  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t07  tRNA-Thr  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.222466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R20  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180694  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0034  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0016  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.168843  normal  0.312064 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0003  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna8  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.222238  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0028  tRNA-Thr  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000154592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0019  tRNA-Thr  83.58 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0035  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.292449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0010  tRNA-Thr  89.74 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.158733  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0004  tRNA-Lys  89.74 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.912706  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0048  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00108032  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0035  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1223  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0426798  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0034  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.129235  normal  0.301569 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0025  tRNA-Thr  86.96 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000414519  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000469989  normal  0.0212427 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0026  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390133  normal  0.0221224 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0056  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000671008  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0034  tRNA-Ala  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00540131 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0030  tRNA-Ala  84.48 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.546773  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6025  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.142522  normal  0.946345 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0038  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000250994  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1415  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 79 bp  44.1  0.005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0042  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.220787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0084  tRNA-Arg  87.04 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000200461  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0078  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.204281 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0087  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0028  tRNA-Thr  85.19 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815956 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0014  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0213488  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Cys-1  tRNA-Cys  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000669045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>