58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1836 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1836  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
438 aa  868    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0425  major facilitator family protein  31.75 
 
 
428 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.950932  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4860  major facilitator family protein CglT  30.12 
 
 
422 aa  193  6e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0068  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
419 aa  189  1e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.774441  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2903  major facilitator family transporter  26.95 
 
 
425 aa  145  1e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.173652  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4031  major facilitator family transporter  26.82 
 
 
425 aa  145  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.80085  normal  0.402393 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3076  major facilitator family transporter  26.95 
 
 
425 aa  143  7e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00169056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02619  predicted transporter  26.42 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0938  major facilitator transporter  26.42 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.90207  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02582  hypothetical protein  26.42 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0914  major facilitator superfamily MFS_1  26.42 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.385609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2914  major facilitator family transporter  26.68 
 
 
425 aa  141  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00716941  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2463  major facilitator transporter  26.06 
 
 
427 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4397  major facilitator transporter  27.93 
 
 
421 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03708  hypothetical protein  27.93 
 
 
421 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.450457  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4259  major facilitator transporter  27.93 
 
 
421 aa  133  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4112  major facilitator superfamily MFS_1  27.93 
 
 
421 aa  133  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4142  major facilitator transporter  27.93 
 
 
421 aa  133  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.810342 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03759  predicted transporter  27.93 
 
 
421 aa  133  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.403502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4101  major facilitator transporter  27.93 
 
 
421 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5320  transporter, major facilitator family  27.93 
 
 
421 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.581076  normal  0.378409 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2061  major facilitator family protein  30.05 
 
 
417 aa  127  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3580  major facilitator transporter  26.57 
 
 
421 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.177538 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07155  hypothetical protein  27.68 
 
 
428 aa  109  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0338  MFS transporter  25.19 
 
 
427 aa  94.4  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0543879  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2836  major facilitator transporter  24.82 
 
 
448 aa  93.6  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.647755  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2823  major facilitator transporter  26.9 
 
 
207 aa  88.2  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3299  major facilitator transporter  24.58 
 
 
433 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3509  major facilitator transporter  28.17 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.36765  normal  0.167547 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2908  major facilitator transporter  24.81 
 
 
423 aa  73.9  0.000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0278927 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0138  hypothetical protein  23.44 
 
 
483 aa  70.5  0.00000000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0835  major facilitator transporter  24.84 
 
 
434 aa  68.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.65824  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0080  major facilitator transporter  24.84 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.163505  hitchhiker  0.00273826 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1991  major facilitator superfamily MFS_1  26.21 
 
 
440 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.359868 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1586  major facilitator superfamily permease  24.27 
 
 
461 aa  55.8  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000240166  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3925  major facilitator transporter  22.41 
 
 
445 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.362735 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0243  major facilitator transporter  23.02 
 
 
410 aa  47  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3001  major facilitator transporter  21.65 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0326  major facilitator transporter  23.91 
 
 
462 aa  46.2  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000804058  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1681  hypothetical protein  40 
 
 
103 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4632  bicyclomycin resistance protein  23.56 
 
 
384 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000966537  hitchhiker  0.00000000000000156092 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0704  bicyclomycin resistance protein  23.08 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0412703  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0137  hypothetical protein  20.13 
 
 
497 aa  45.8  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0566  major facilitator transporter  21.68 
 
 
384 aa  44.7  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000941679  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3025  major facilitator transporter  21.76 
 
 
422 aa  44.7  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1684  hypothetical protein  34.85 
 
 
90 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  26.45 
 
 
446 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0719  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.15 
 
 
388 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0735  major facilitator superfamily multidrug/H(+) antiporter  25.15 
 
 
388 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4129  MFS family transporter  33.72 
 
 
480 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43167  high affinity nicotinic acid plasma membrane permease  22.84 
 
 
462 aa  43.9  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.460781 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1660  major facilitator superfamily transporter  31 
 
 
510 aa  43.9  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal  0.926796 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  32.93 
 
 
406 aa  43.5  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02980  hypothetical protein  24.53 
 
 
598 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.157268  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0353  quinolone resistance protein NorA  29.66 
 
 
387 aa  43.5  0.007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.390077  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1430  major facilitator transporter  27.22 
 
 
480 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00164938 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04109  MFS transporter Liz1/Seo1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00980)  21.25 
 
 
505 aa  43.1  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5537  major facilitator transporter  25.46 
 
 
450 aa  43.1  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>