49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0935 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0935  ParB domain protein nuclease  100 
 
 
307 aa  619  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.167153 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1523  ParB domain protein nuclease  56.56 
 
 
309 aa  269  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.10423 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2411  ParB domain protein nuclease  36.55 
 
 
284 aa  155  7e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000114974  normal  0.682432 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1565  parB-like partition protein  28.88 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3042  parB-like partition protein  39.58 
 
 
294 aa  56.2  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  31.93 
 
 
312 aa  53.5  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2030  parB-like partition protein  26.8 
 
 
306 aa  52.4  0.000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.816582  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2897  parB-like partition protein  28.28 
 
 
314 aa  51.6  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.024041  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  29.63 
 
 
287 aa  49.3  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3531  parB-like partition protein  26.44 
 
 
307 aa  49.3  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210868  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0008  ParB family partitioning protein  36.62 
 
 
294 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1724  parB-like partition protein  27.46 
 
 
317 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3116  parB-like partition protein  29.57 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  hitchhiker  0.0000000669867 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0203  parB-like partition protein  40.26 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07110  putative ParB-like chromosome partitioning protein  30.17 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.629083  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  26.58 
 
 
283 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0207  parB-like partition protein  32.46 
 
 
305 aa  47  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0115162  normal  0.222664 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14140  ParB-like partition protein  38.27 
 
 
401 aa  47  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4490  parB-like partition protein  33.91 
 
 
298 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4509  parB-like partition protein  33.91 
 
 
298 aa  46.2  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4501  parB-like partition protein  33.62 
 
 
298 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.125529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5274  parB-like partition protein  32.76 
 
 
290 aa  45.8  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5178  stage 0 sporulation protein J  35.05 
 
 
290 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5632  stage 0 sporulation protein J, putative  35.05 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5334  stage 0 sporulation protein J  35.05 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5162  stage 0 sporulation protein J  35.05 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0004  parB-like partition protein  30 
 
 
314 aa  45.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5731  stage 0 sporulation protein J  35.05 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4354  chromosome segregation DNA-binding protein  28.33 
 
 
298 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.364626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5591  putative stage 0 sporulation protein J  35.05 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000383543 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5668  putative stage 0 sporulation protein J  35.05 
 
 
290 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1743  Spo0J-like protein  31.06 
 
 
293 aa  44.7  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000307914  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1331  parB-like partition protein  38.16 
 
 
269 aa  45.1  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000205229 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0133  chromosome segregation DNA-binding protein  30.6 
 
 
315 aa  44.3  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3588  parB-like partition protein  27.47 
 
 
323 aa  43.9  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5327  putative stage 0 sporulation protein J  31.9 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000449265 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0040  chromosome segregation DNA-binding protein  35.04 
 
 
298 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5608  putative stage 0 sporulation protein J  31.9 
 
 
290 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.978338  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2403  parB-like partition protein  40.3 
 
 
292 aa  43.9  0.004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.117345  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2229  parB-like partition protein  40.98 
 
 
286 aa  43.5  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6576  parB-like partition protein  32.04 
 
 
324 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0152198  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0451  parB-like partition protein  25.91 
 
 
317 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0966638  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4021  parB-like partition protein  30.99 
 
 
290 aa  43.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0831  parB-like partition protein  29.31 
 
 
273 aa  42.7  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0219556  unclonable  0.000011796 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0014  ParB-like partition protein  31.71 
 
 
284 aa  42.7  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.357809  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  31.88 
 
 
645 aa  42.7  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1887  parB-like partition protein  34 
 
 
294 aa  42.7  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0001  ParB family chromosome partitioning protein  31.9 
 
 
256 aa  42.7  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0794008  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4544  parB-like partition proteins  35.11 
 
 
336 aa  42.7  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.0000000207738  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>