32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3442 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3442  antirestriction protein  100 
 
 		 156 aa  328  2e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4681  antirestriction protein  71.43 
 
 		 159 aa  228  3e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4803  antirestriction protein  66.46 
 
 		 161 aa  224  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3358  Antirestriction protein  70.63 
 
 		 152 aa  221  2e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0307  antirestriction protein  71.53 
 
 		 152 aa  218  3e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147362  hitchhiker  0.00255459 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1033  Antirestriction protein  66.03 
 
 		 152 aa  218  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3349  antirestriction protein  67.55 
 
 		 160 aa  215  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4895  antirestriction protein  68.46 
 
 		 157 aa  209  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1401  antirestriction protein  67.11 
 
 		 161 aa  209  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0932119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2247  antirestriction protein  67.76 
 
 		 161 aa  207  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3409  antirestriction protein  63.98 
 
 		 161 aa  207  4e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1063  antirestriction protein  63.92 
 
 		 159 aa  204  3e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0944493 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3208  antirestriction protein  63.92 
 
 		 159 aa  201  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1124  antirestriction protein  63.29 
 
 		 159 aa  199  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2854  antirestriction protein  62.66 
 
 		 159 aa  196  9e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0792821 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0752  antirestriction ArdB family protein  58.21 
 
 		 143 aa  178  2.9999999999999997e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1773  antirestriction protein  54.49 
 
 		 152 aa  174  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00212172  normal  0.028767 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4298  antirestriction protein  39.42 
 
 		 143 aa  100  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  hitchhiker  0.0000077834  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0047  hypothetical protein  38.06 
 
 		 134 aa  95.1  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  decreased coverage  0.00602807  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7558  antirestriction protein  36.69 
 
 		 137 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0322633 
 
 
-
 
NC_008385  Bamb_6596  antirestriction protein  35.46 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0289117  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3822  antirestriction protein  36.15 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6452  antirestriction protein  36.81 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0514238  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4600  antirestriction protein  35.07 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3374  antirestriction protein  32.37 
 
 		 136 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000803428  unclonable  1.57531e-17 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3173  antirestriction protein  40.6 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0604984  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5243  antirestriction protein  35.26 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0065  putative antirestriction protein  30 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0508251 
 
 
-
 
NC_009787  EcE24377A_C0009  antirestriction protein  30 
 
 		 141 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0005  antirestriction family protein  29.29 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0055  antirestriction protein  28.57 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000895421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0047  putative antirestriction protein  27.86 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0721486  normal  0.0114762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>