23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3510 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3510  SWIM zinc finger domain-containing protein  100 
 
 		 440 aa  900    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4848  zinc finger SWIM domain-containing protein  41.4 
 
 		 481 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2427  zinc finger SWIM domain protein  36.22 
 
 		 442 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579091 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3737  zinc finger SWIM domain-containing protein  41.78 
 
 		 461 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436415  normal  0.0662307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6475  zinc finger SWIM domain protein  35.86 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.021657  normal  0.0781791 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0758  zinc finger SWIM domain protein  36.01 
 
 		 434 aa  232  9e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4020  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.4 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1844  zinc finger SWIM domain protein  37.81 
 
 		 449 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000517508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7993  zinc finger SWIM domain protein  35.59 
 
 		 459 aa  216  9e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2175  zinc finger SWIM domain-containing protein  36.53 
 
 		 425 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4681  zinc finger SWIM domain protein  34.23 
 
 		 435 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1514  zinc finger SWIM domain protein  38.74 
 
 		 455 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0734155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1514  zinc finger SWIM domain-containing protein  35.25 
 
 		 455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.543823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1793  zinc finger SWIM domain protein  38.86 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253806  normal  0.0159475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1275  zinc finger SWIM domain protein  37.96 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.137787  normal  0.0755473 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1457  hypothetical protein  32.5 
 
 		 444 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.041762  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4582  zinc finger SWIM domain protein  34.13 
 
 		 415 aa  176  7e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2405  zinc finger SWIM domain protein  34.02 
 
 		 435 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000238386  decreased coverage  0.000116263 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2049  zinc finger SWIM domain protein  32.81 
 
 		 464 aa  173  5e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00765998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1551  zinc finger SWIM domain-containing protein  33.18 
 
 		 1059 aa  156  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.712758 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2017  zinc finger SWIM domain protein  30.64 
 
 		 481 aa  99.8  8e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1468  zinc finger SWIM domain-containing protein  41.51 
 
 		 157 aa  43.1  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0038346  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1439  zinc finger SWIM domain-containing protein  41.51 
 
 		 157 aa  43.1  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>