20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3432 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0723  conserved hypothetical protein  92.37 
 
 		 1520 aa  2776    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02792  hypothetical protein  90.78 
 
 		 1517 aa  2732    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00846982  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3251  hypothetical protein  93.17 
 
 		 1518 aa  2793    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2636  inner membrane lipoprotein  38.56 
 
 		 1426 aa  932    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.98205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3432  hypothetical protein  100 
 
 		 1506 aa  3132    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3142  hypothetical protein  93.1 
 
 		 1503 aa  2787    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0370  putative lipoprotein  49.59 
 
 		 1443 aa  1368    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02842  predicted inner membrane lipoprotein  90.78 
 
 		 1517 aa  2732    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00831057  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0727  hypothetical protein  90.76 
 
 		 143 aa  99.8  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2078  fam139a; Protein FAM139A  30.06 
 
 		 785 aa  96.7  3e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1514  hypothetical protein  27.7 
 
 		 660 aa  93.6  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.767692  hitchhiker  0.00000248553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2532  hypothetical protein  20.35 
 
 		 770 aa  54.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  55.56 
 
 		 268 aa  49.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1386  hypothetical protein  41.18 
 
 		 529 aa  48.5  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257961  normal  0.650962 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4248  hypothetical protein  24.17 
 
 		 824 aa  47.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4013  peptidoglycan-binding LysM  38.03 
 
 		 203 aa  47  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0945  intradiol ring-cleavage dioxygenase  34.12 
 
 		 288 aa  46.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3466  SH3 type 3 domain-containing protein  43.4 
 
 		 1281 aa  46.6  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.180669  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  53.33 
 
 		 444 aa  46.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  43.48 
 
 		 484 aa  45.8  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>