48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_1419 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  100 
 
 		 284 aa  593  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1251  putative phage regulatory protein, Rha family  50 
 
 		 282 aa  223  3e-57  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000124427  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  54.12 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2510  Rha family phage regulatory protein  50.48 
 
 		 207 aa  115  8.999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2502  Rha family phage regulatory protein  49.12 
 
 		 200 aa  108  9.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.526208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2607  hypothetical protein  51.55 
 
 		 172 aa  107  2e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.113309  normal  0.0343315 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0897  phage regulatory protein, Rha family  51.61 
 
 		 167 aa  99.4  7e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.194242  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1059  antirepressor, putative  44.95 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0737012  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0863  uncharacterized phage-encoded protein  45.45 
 
 		 243 aa  91.7  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  1.18472e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4461  putative antirepressor  44.23 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0306  Rha family phage regulatory protein  44 
 
 		 184 aa  90.1  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1974  phage regulatory protein, Rha family  42.42 
 
 		 256 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.452898  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a011  putative antirepressor, Rha family  41.46 
 
 		 194 aa  82.4  0.000000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1737  phage-encoded protein-like  42.31 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2989  phage regulatory protein, Rha family  39.64 
 
 		 231 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.347787  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0764  Rha family phage regulatory protein  30.51 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1666  phage-encoded protein-like protein  31.07 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.279039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0795  Rha family phage regulatory protein  30.51 
 
 		 194 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.142717 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3314  phage-encoded protein-like  34.33 
 
 		 242 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2806  rha protein, phage phi-80  54.41 
 
 		 72 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.022492  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1731  phage-encoded protein-like  52.11 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2343  hypothetical protein  39.05 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.259786  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3107  putative CI repressor  43.24 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.505611  normal  0.201687 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2799  phage-encoded protein-like  39.42 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.181279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3131  phage-encoded protein-like protein  47.83 
 
 		 91 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0841  Cpp32  36.59 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000551313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1505  antirepressor  36.96 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1453  hypothetical protein  47.83 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000091226  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1464  phage anti-repressor protein  41.67 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521723  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2652  Rha family phage regulatory protein  29.75 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1382  hypothetical protein  40.26 
 
 		 128 aa  64.7  0.000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.469514  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0838  Cpp32  35.54 
 
 		 245 aa  63.5  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00488204  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0597  phage regulatory protein, Rha family  33.33 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2645  phage immunity repressor protein  47.22 
 
 		 131 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000108991 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0029  cpp32  34.26 
 
 		 188 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3827  hypothetical protein  34.65 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.691493  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3543  hypothetical protein  34.65 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0434  hypothetical protein  28.57 
 
 		 243 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000483628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0420  hypothetical protein  28.57 
 
 		 250 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000377873  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3457  antirepressor  31.3 
 
 		 236 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000836104  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1046  Rha family phage regulatory protein  31.68 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00498472  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1027  Rha family phage regulatory protein  31.68 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000867167  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1057  putative bacteriophage protein  28.8 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4078  hypothetical protein  35 
 
 		 262 aa  50.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0047  putative bacteriophage protein  28.8 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0317  protein ash  33.88 
 
 		 110 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.387224 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3463  Rha family regulatory protein  26.19 
 
 		 233 aa  48.5  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4007  phage protein  27.14 
 
 		 134 aa  42  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>