16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C2645 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2645  phage immunity repressor protein  100 
 
 
131 aa  264  2.9999999999999995e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000108991 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3107  putative CI repressor  57.55 
 
 
183 aa  121  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.505611  normal  0.201687 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4007  phage protein  47.66 
 
 
134 aa  105  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0047  putative bacteriophage protein  47.66 
 
 
196 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1057  putative bacteriophage protein  47.66 
 
 
196 aa  105  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0317  protein ash  51.35 
 
 
110 aa  101  3e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.387224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2961  phage immunity repressor protein  54.84 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  hitchhiker  0.00000287502 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4844  phage immunity repressor protein  52.46 
 
 
63 aa  65.5  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.369525 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  47.22 
 
 
284 aa  61.6  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4078  hypothetical protein  36.54 
 
 
262 aa  52  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0377  phage immunity repressor protein  43.4 
 
 
58 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.114796  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4779  phage immunity repressor protein  43.4 
 
 
58 aa  52  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4167  hypothetical protein  41.94 
 
 
350 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3883  hypothetical protein  49.09 
 
 
243 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2366  hypothetical protein  43.1 
 
 
66 aa  47  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.251457  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2286  putative antirepressor  40 
 
 
380 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.36993  hitchhiker  4.73451e-22 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>