13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_0047 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0047  putative bacteriophage protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1057  putative bacteriophage protein  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4007  phage protein  99.25 
 
 		 134 aa  270  8.000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3107  putative CI repressor  57.95 
 
 		 183 aa  198  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.505611  normal  0.201687 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0317  protein ash  65.14 
 
 		 110 aa  139  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.387224 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2961  phage immunity repressor protein  85.25 
 
 		 64 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.576414  hitchhiker  0.00000287502 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2645  phage immunity repressor protein  47.66 
 
 		 131 aa  105  5e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000108991 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4844  phage immunity repressor protein  72.58 
 
 		 63 aa  90.1  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.369525 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4078  hypothetical protein  38.69 
 
 		 262 aa  75.1  0.0000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1419  Rha family phage regulatory protein  28.8 
 
 		 284 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000100347  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0377  phage immunity repressor protein  54.35 
 
 		 58 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.114796  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4779  phage immunity repressor protein  54.35 
 
 		 58 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3883  hypothetical protein  43.64 
 
 		 243 aa  45.1  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>