152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0173 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_4907  serine transporter family protein  99.05 
 
 		 423 aa  839    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03390  predicted transporter  100 
 
 		 423 aa  847    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0173  serine transporter  100 
 
 		 423 aa  847    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3837  inner membrane transport protein YhaO  85 
 
 		 432 aa  708    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3823  inner membrane transport protein YhaO  85.48 
 
 		 432 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3945  inner membrane transport protein YhaO  85.48 
 
 		 432 aa  711    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0500028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3738  serine transporter family protein  100 
 
 		 423 aa  847    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4031  serine transporter family protein  99.76 
 
 		 423 aa  845    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4005  inner membrane transport protein YhaO  85.24 
 
 		 432 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0176  serine transporter  100 
 
 		 423 aa  847    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3901  inner membrane transport protein YhaO  85.24 
 
 		 432 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3858  serine transporter family protein  99.29 
 
 		 423 aa  842    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3992  serine transporter family protein  99.76 
 
 		 423 aa  845    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3807  putative serine transporter  62.09 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0644  putative serine transporter  62.09 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0912478 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3895  putative transmembrane transport protein  62.09 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3534  inner membrane transport protein YhaO  45.69 
 
 		 479 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.846791 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3430  inner membrane transport protein YhaO  45.69 
 
 		 479 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.763252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3427  inner membrane transport protein YhaO  45.69 
 
 		 479 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3248  serine transporter family protein  45.43 
 
 		 443 aa  387  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40747  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3501  inner membrane transport protein YhaO  45.69 
 
 		 479 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02978  predicted transporter  45.19 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0592  serine transporter  45.19 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02929  hypothetical protein  45.19 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3597  inner membrane transport protein YhaO  45.45 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.752822  normal  0.938975 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4424  serine transporter family protein  45.19 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3585  serine transporter family protein  45.19 
 
 		 443 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0587  serine transporter  44.95 
 
 		 443 aa  382  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3407  serine transporter family protein  45.19 
 
 		 443 aa  384  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3299  serine transporter family protein  44.95 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2791  HAAAP family transport protein  43.61 
 
 		 423 aa  365  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2970  HAAAP family transport protein  43.61 
 
 		 423 aa  364  1e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2874  HAAAP family transport protein  43.61 
 
 		 423 aa  364  2e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.547071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4890  serine transporter  42.58 
 
 		 433 aa  362  6e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002891  serine transporter  42.23 
 
 		 441 aa  361  2e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3078  HAAAP family transport protein  43.61 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.283138  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3221  HAAAP family transport protein  43.61 
 
 		 423 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3068  HAAAP family transport protein  43.61 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0327744  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1298  HAAAP family transport protein  43.61 
 
 		 423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0139419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0810  serine transporter  43.86 
 
 		 442 aa  346  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001600  serine transporter  27.18 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05580  hypothetical protein  27.43 
 
 		 418 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0861  aromatic amino acid permease  27.59 
 
 		 431 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3483  aromatic amino acid permease  26 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0765  aromatic amino acid permease  26 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3552  aromatic amino acid permease  26 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0858  aromatic amino acid permease  25.81 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3674  aromatic amino acid permease  26 
 
 		 431 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0761  amino acid transporter, transmembrane  27 
 
 		 430 aa  141  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3262  amino acid transporter, transmembrane  26.68 
 
 		 430 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3365  serine transporter, putative  27.07 
 
 		 430 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0919  serine transporter, putative  26.93 
 
 		 430 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0863  aromatic amino acid permease  26.48 
 
 		 423 aa  139  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0739  aromatic amino acid permease  26.64 
 
 		 423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2772  amino acid transporter, transmembrane  25.81 
 
 		 438 aa  137  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1760  threonine/serine transporter  26.52 
 
 		 425 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2327  aromatic amino acid permease  25.38 
 
 		 426 aa  136  8e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3633  threonine/serine transporter  26.01 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.04757 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3396  aromatic amino acid permease  26.21 
 
 		 426 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2183  aromatic amino acid permease  25.13 
 
 		 426 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2804  amino acid transporter transmembrane  26.21 
 
 		 425 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3589  aromatic amino acid ABC transporter permease  25.13 
 
 		 426 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0919  serine transporter  25.06 
 
 		 433 aa  126  6e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1262  serine transporter  26.2 
 
 		 417 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.040396  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1242  serine transporter  26.43 
 
 		 427 aa  124  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0363509  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3101  serine transporter family protein  25.55 
 
 		 429 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.41481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02641  predicted serine transporter  25.3 
 
 		 429 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0892  serine transporter  25.3 
 
 		 429 aa  124  5e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2940  serine transporter family protein  25.3 
 
 		 429 aa  124  5e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.271081  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02603  hypothetical protein  25.3 
 
 		 429 aa  124  5e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4060  serine transporter family protein  25.3 
 
 		 429 aa  124  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2127  serine transporter, putative  25 
 
 		 453 aa  123  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2936  serine transporter family protein  25.55 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0834253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3076  serine transporter family protein  25.3 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.119779  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2241  hypothetical protein  27 
 
 		 431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0916  serine transporter  25.06 
 
 		 429 aa  121  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2939  serine transporter  27.3 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.557142  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2269  hypothetical protein  26.75 
 
 		 431 aa  120  3e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2656  serine transporter  26.6 
 
 		 433 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2739  serine transporter  26.6 
 
 		 433 aa  120  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1550  serine transporter  26.6 
 
 		 440 aa  120  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1339  serine transporter  27.54 
 
 		 429 aa  119  7e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01909  hypothetical protein  28.83 
 
 		 422 aa  119  7e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2484  serine/threonine transporter family protein  24.42 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3066  serine/threonine transporter family protein  24.42 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.619234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3306  serine/threonine transporter family protein  24.42 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243696  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0919  serine transporter  27.81 
 
 		 417 aa  118  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110337  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5569  aromatic amino acid permease  24.31 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.179015 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1344  serine transporter  27.86 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1630  serine transporter  26.26 
 
 		 431 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.80045  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0771  aromatic amino acid permease  24.1 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630004  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2397  putative serine transporter  24.94 
 
 		 430 aa  117  3e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003156  serine transporter  26.32 
 
 		 417 aa  117  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3286  serine/threonine transporter family protein  24.42 
 
 		 439 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0423  serine transporter  22.76 
 
 		 413 aa  117  5e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3130  serine transporter family protein  24.63 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805755  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3293  serine transporter family protein  24.63 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.412902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3113  serine transporter family protein  24.63 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109135  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3178  serine transporter family protein  24.63 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.509174 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3193  serine transporter family protein  24.63 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>