46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1642 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1642  major facilitator superfamily transporter  100 
 
 		 394 aa  761    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.511036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0241  major facilitator superfamily MFS_1  51.59 
 
 		 405 aa  355  1e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0694015 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1703  hypothetical protein  46.33 
 
 		 391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0033  major facilitator superfamily MFS_1  32.12 
 
 		 409 aa  161  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1679  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 396 aa  138  2e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  25.77 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  24.09 
 
 		 411 aa  56.2  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  27.24 
 
 		 403 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  26.52 
 
 		 403 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  23.47 
 
 		 404 aa  51.2  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  24.51 
 
 		 414 aa  50.8  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  27.4 
 
 		 403 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  23.05 
 
 		 404 aa  50.4  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  25.95 
 
 		 395 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6607  major facilitator transporter  23.9 
 
 		 439 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.806643  normal  0.758649 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0061  major facilitator superfamily MFS_1  23.96 
 
 		 449 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1131  major facilitator transporter  23.66 
 
 		 451 aa  47  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.727558  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1794  Xaa-Pro dipeptidase  23.14 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  27.08 
 
 		 403 aa  46.2  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0067  major facilitator superfamily MFS_1  23.04 
 
 		 449 aa  46.2  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  22.59 
 
 		 404 aa  46.2  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3842  major facilitator transporter  22.11 
 
 		 420 aa  46.2  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  25.99 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5869  transporter, major facilitator family  20.76 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  24.29 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  27.95 
 
 		 411 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04199  hypothetical protein  20.76 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3641  major facilitator superfamily MFS_1  20.76 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4901  major facilitator transporter  20.76 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.449685  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3862  major facilitator transporter  27.98 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04233  predicted transporter  20.76 
 
 		 453 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4948  major facilitator transporter  20.76 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.470711  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4587  major facilitator transporter  20.76 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3699  major facilitator transporter  20.76 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0619657 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4592  major facilitator transporter  24.07 
 
 		 440 aa  44.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.947939 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  27.3 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3053  sugar phosphate permease-like  23.79 
 
 		 435 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.32352  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  29.12 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6125  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 439 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.444392 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3046  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 390 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0751407 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5760  major facilitator transporter  23.53 
 
 		 439 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2354  MFS transporter  29.2 
 
 		 383 aa  43.5  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.632575 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7622  major facilitator transporter  24.26 
 
 		 439 aa  43.5  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.388014  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  27.27 
 
 		 395 aa  43.1  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2783  major facilitator transporter  27.92 
 
 		 409 aa  43.1  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.35447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 418 aa  42.7  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>