More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0092 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2107  response regulator receiver protein  59.17 
 
 		 768 aa  772    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2668  response regulator receiver protein  66.82 
 
 		 675 aa  864    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0092  response regulator receiver protein  100 
 
 		 682 aa  1351    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  48.81 
 
 		 817 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3214  Lon-A peptidase  49.78 
 
 		 823 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115305  hitchhiker  0.000000048524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  49.45 
 
 		 817 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1560  ATP-dependent protease La  48.81 
 
 		 792 aa  461  9.999999999999999e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2544  peptidase S16, ATP-dependent protease La  50.44 
 
 		 774 aa  458  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.16871  hitchhiker  0.0000000000000339276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  49.45 
 
 		 816 aa  459  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3193  ATP-dependent protease La  49.34 
 
 		 819 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2559  ATP-dependent protease La  46.86 
 
 		 810 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0531  Lon-A peptidase  50.79 
 
 		 768 aa  454  1.0000000000000001e-126  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000877407  normal  0.534279 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3353  ATP-dependent protease La  48.89 
 
 		 806 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.273973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1653  endopeptidase La  47.73 
 
 		 812 aa  455  1.0000000000000001e-126  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1982  ATP-dependent protease La  49.67 
 
 		 796 aa  450  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3207  ATP-dependent protease La  43.83 
 
 		 771 aa  452  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  47.83 
 
 		 816 aa  452  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1476  ATP-dependent protease La  49.11 
 
 		 797 aa  447  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.10535  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  49.23 
 
 		 825 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2778  ATP-dependent protease La  49.89 
 
 		 802 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0700  ATP-dependent protease La  47.4 
 
 		 794 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000293647 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3815  ATP-dependent protease La  50 
 
 		 783 aa  443  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0134568  normal  0.586345 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0027  ATP-dependent protease La  51.09 
 
 		 780 aa  443  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1079  ATP-dependent protease La  50.57 
 
 		 824 aa  444  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932404  normal  0.310729 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2122  ATP-dependent protease La  47.03 
 
 		 806 aa  442  1e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0689  ATP-dependent protease La  47.38 
 
 		 794 aa  443  1e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0785815  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  45.97 
 
 		 775 aa  443  1e-123  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0923  ATP-dependent protease La  49.56 
 
 		 768 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.469198  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1955  ATP-dependent protease La  47.13 
 
 		 805 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1463  ATP-dependent protease La  47.13 
 
 		 805 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.114197  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2479  ATP-dependent protease La  47.13 
 
 		 805 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.71727  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2321  ATP-dependent protease La  47.13 
 
 		 805 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00784653  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1230  ATP-dependent protease La  47.13 
 
 		 805 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  46.34 
 
 		 811 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  47.24 
 
 		 804 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3350  ATP-dependent protease La  47.13 
 
 		 805 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00464678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2363  ATP-dependent protease La  47.13 
 
 		 805 aa  442  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2557  ATP-dependent protease La  49.79 
 
 		 802 aa  440  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0122618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  47.24 
 
 		 804 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  49.31 
 
 		 797 aa  436  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1713  ATP-dependent protease LA protein  48.1 
 
 		 806 aa  439  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.0334567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2098  ATP-dependent protease La  51.64 
 
 		 828 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.293508 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1169  ATP-dependent protease La  51.29 
 
 		 809 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0714887  normal  0.0235263 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3615  ATP-dependent protease La  49.15 
 
 		 788 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0994  ATP-dependent protease La  51.16 
 
 		 786 aa  438  1e-121  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0985601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1392  ATP-dependent protease La  50.93 
 
 		 800 aa  438  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0489  ATP-dependent protease La  47.8 
 
 		 772 aa  437  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.263842  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2996  ATP-dependent protease La  49.08 
 
 		 815 aa  437  1e-121  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2293  Lon-A peptidase  48.02 
 
 		 807 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.441771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5273  ATP-dependent protease La  50 
 
 		 805 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1013  ATP-dependent protease La  48.02 
 
 		 805 aa  439  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0952108  normal  0.956035 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  46.33 
 
 		 815 aa  438  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0560  ATP-dependent protease La  47.48 
 
 		 807 aa  437  1e-121  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1908  ATP-dependent protease La  47.8 
 
 		 807 aa  435  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1716  Lon-A peptidase  47.36 
 
 		 804 aa  435  1e-120  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.390297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1839  ATP-dependent protease La  47.57 
 
 		 807 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.419381  normal  0.0156461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5222  Lon-A peptidase  47.57 
 
 		 807 aa  435  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0116  ATP-dependent protease La  49.65 
 
 		 800 aa  432  1e-120  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000170632  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1610  Lon-A peptidase  45.13 
 
 		 805 aa  432  1e-120  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000614629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4368  ATP-dependent protease La  46.78 
 
 		 804 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1883  Lon-A peptidase  47.12 
 
 		 803 aa  433  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6158  ATP-dependent protease La  47.57 
 
 		 807 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14910  ATP-dependent protease La  46.19 
 
 		 783 aa  434  1e-120  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1944  ATP-dependent protease La  47.57 
 
 		 807 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1909  ATP-dependent protease La  47.57 
 
 		 807 aa  433  1e-120  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1921  ATP-dependent protease La  47.57 
 
 		 807 aa  434  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  46.24 
 
 		 823 aa  435  1e-120  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2299  ATP-dependent protease La  46.09 
 
 		 778 aa  432  1e-119  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1856  ATP-dependent protease La  47.98 
 
 		 820 aa  432  1e-119  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0499044  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  49.56 
 
 		 786 aa  431  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1675  Lon-A peptidase  46.19 
 
 		 805 aa  432  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0439877 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  47.23 
 
 		 774 aa  429  1e-119  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2338  ATP-dependent protease La  46.02 
 
 		 803 aa  429  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0304727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1707  ATP-dependent protease La  51.18 
 
 		 843 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00968626  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0683  ATP-dependent protease La  47.32 
 
 		 810 aa  430  1e-119  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0018045  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1351  ATP-dependent protease La  47.76 
 
 		 808 aa  432  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.183525 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  50.94 
 
 		 835 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3439  ATP-dependent protease La  51.85 
 
 		 836 aa  431  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.105513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2051  ATP-dependent protease La  48.58 
 
 		 814 aa  432  1e-119  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  50.71 
 
 		 835 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2542  ATP-dependent protease La  46.58 
 
 		 805 aa  428  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142906 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0836  ATP-dependent protease La  50.69 
 
 		 846 aa  426  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0053  ATP-dependent protease La  46.88 
 
 		 804 aa  426  1e-118  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.000000930171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0513  ATP-dependent protease La  49.53 
 
 		 815 aa  426  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00559437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1605  ATP-dependent protease La  50.22 
 
 		 835 aa  429  1e-118  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.269536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0536  ATP-dependent protease La  49.77 
 
 		 808 aa  429  1e-118  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0694  ATP-dependent protease La  49.41 
 
 		 813 aa  426  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.243071  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  48.64 
 
 		 775 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2153  ATP-dependent protease La  49.19 
 
 		 813 aa  428  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.582641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  48.24 
 
 		 806 aa  428  1e-118  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  48.24 
 
 		 806 aa  428  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1246  ATP-dependent protease La  47.52 
 
 		 772 aa  428  1e-118  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3184  ATP-dependent protease La  45.76 
 
 		 773 aa  423  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.899405  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4367  ATP-dependent protease La 1  46.78 
 
 		 776 aa  422  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000611183  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1382  Lon-A peptidase  47.35 
 
 		 803 aa  425  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.154392  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  46.7 
 
 		 810 aa  425  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0531  endopeptidase La  46.15 
 
 		 823 aa  424  1e-117  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1556  ATP-dependent protease La  40.1 
 
 		 813 aa  423  1e-117  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  46.15 
 
 		 823 aa  425  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0715  ATP-dependent protease La  46.65 
 
 		 790 aa  424  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>