224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3040 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3040  coenzyme A binding protein  100 
 
 		 140 aa  282  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1988  CoA-binding domain-containing protein  71.94 
 
 		 140 aa  210  4.9999999999999996e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.370858  normal  0.185314 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1304  coenzyme A binding protein  65.19 
 
 		 136 aa  188  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0987  CoA-binding domain-containing protein  59.4 
 
 		 143 aa  169  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2330  CoA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 140 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4331  CoA-binding domain-containing protein  44.36 
 
 		 182 aa  99.4  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.282355 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0196  CoA-binding domain-containing protein  34.62 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0111004  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0725  CoA-binding domain-containing protein  35.34 
 
 		 139 aa  96.7  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000455945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2493  CoA-binding domain-containing protein  38.52 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.244493  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0272  CoA-binding domain protein  37.68 
 
 		 136 aa  92  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0803  CoA-binding domain protein  36.09 
 
 		 139 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.628448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1330  hypothetical protein  34.85 
 
 		 139 aa  91.3  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1166  CoA-binding  39.85 
 
 		 145 aa  90.9  5e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.365479  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2850  CoA-binding domain protein  37.59 
 
 		 137 aa  90.5  7e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0301124  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2827  hypothetical protein  39.39 
 
 		 133 aa  89.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0856697 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3193  CoA-binding domain protein  40.77 
 
 		 181 aa  89.7  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1141  CoA-binding domain protein  37.6 
 
 		 134 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1616  CoA-binding domain protein  37.3 
 
 		 139 aa  88.6  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000180037  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3286  CoA-binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 137 aa  89  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.120452  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2868  CoA-binding domain-containing protein  31.62 
 
 		 149 aa  88.2  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000106484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1005  CoA-binding domain protein  35.34 
 
 		 135 aa  87.8  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.122107 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1479  CoA-binding domain protein  35.61 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.338285 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2525  hypothetical protein  40.46 
 
 		 139 aa  87  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.550629  normal  0.199882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3121  CoA-binding domain protein  36.22 
 
 		 134 aa  86.7  9e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1608  CoA binding domain family protein  36.07 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000441527  hitchhiker  0.00000000000716402 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2541  CoA-binding domain protein  35.34 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0262048  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1762  CoA-binding domain-containing protein  37.59 
 
 		 137 aa  85.9  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0753564  hitchhiker  0.000576354 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1477  CoA-binding domain-containing protein  39.37 
 
 		 137 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3394  CoA-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0763288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3356  CoA-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000642937  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3610  CoA binding domain family protein  36.07 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5882599999999998e-27 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3659  CoA-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000120048  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1144  CoA-binding  31.78 
 
 		 142 aa  85.5  2e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3707  CoA binding domain family protein  36.07 
 
 		 137 aa  85.5  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000701886  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3640  CoA-binding domain protein  38.46 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.491101  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1943  CoA-binding  30.77 
 
 		 142 aa  85.9  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.19202  normal  0.743605 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3625  CoA binding domain family protein  34.81 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000648968  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3618  CoA-binding domain-containing protein  34.81 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000227272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3306  CoA-binding domain-containing protein  36.07 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.007751  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0095  CoA-binding domain protein  37.88 
 
 		 137 aa  84.7  3e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.784423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2559  CoA-binding domain protein  37.7 
 
 		 139 aa  84.7  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1687  hypothetical protein  34.81 
 
 		 150 aa  84.7  4e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.863027  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2631  CoA-binding domain-containing protein  39.37 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.107585  hitchhiker  0.0000174059 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1080  putative CoA-binding protein  39.37 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000019546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1074  putative CoA-binding protein  39.37 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000354787  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3341  CoA-binding domain-containing protein  33.82 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2350  putative CoA-binding protein  39.37 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.409848  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1130  putative CoA-binding protein  39.37 
 
 		 137 aa  84.3  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.95435  normal  0.214224 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1015  CoA-binding domain protein  32.58 
 
 		 144 aa  84  6e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1328  CoA-binding domain protein  36.3 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0242548  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0429  CoA-binding domain protein  36.15 
 
 		 140 aa  84  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1241  CoA-binding domain protein  36.03 
 
 		 142 aa  83.6  8e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00969  predicted CoA-binding protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  38.58 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.480259  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2678  CoA-binding domain protein  38.58 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.301404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2337  CoA-binding protein  34.13 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0375  CoA-binding domain-containing protein  39.85 
 
 		 154 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.319746  normal  0.413983 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1049  CoA-binding domain protein  32.12 
 
 		 138 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00976  hypothetical protein  38.58 
 
 		 137 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.688177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2248  CoA-binding domain-containing protein  35.25 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000439003  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5334  CoA-binding protein  39.23 
 
 		 144 aa  82  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2153  putative CoA-binding protein  38.58 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.191615  normal  0.321485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2340  CoA-binding domain protein  36.43 
 
 		 179 aa  82  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4587  CoA-binding domain protein  35.38 
 
 		 142 aa  80.9  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2004  CoA-binding domain protein  38.17 
 
 		 135 aa  80.9  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0324646 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2489  CoA-binding domain-containing protein  34.59 
 
 		 193 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2712  CoA-binding domain protein  34.59 
 
 		 193 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.350227  normal  0.777581 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1762  CoA-binding domain protein  39.69 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.823906  normal  0.0190292 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1217  CoA-binding domain protein  33.83 
 
 		 137 aa  79.3  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2085  CoA-binding domain protein  30.77 
 
 		 154 aa  79.3  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0390  CoA-binding domain-containing protein  34.33 
 
 		 146 aa  79.3  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6244  CoA-binding domain protein  32.58 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0237327  normal  0.436836 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2052  CoA-binding  34.06 
 
 		 154 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2396  CoA-binding  29.69 
 
 		 138 aa  79  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.972486  normal  0.74538 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0742  CoA-binding domain-containing protein  29.5 
 
 		 159 aa  78.2  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000457668  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02340  predicted CoA-binding protein  36.76 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0145  CoA-binding domain protein  36.15 
 
 		 181 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2254  CoA-binding domain-containing protein  39.42 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0324206  normal  0.212356 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4615  CoA-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.305914  normal  0.0136961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1289  CoA-binding domain-containing protein  33.09 
 
 		 151 aa  77  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.490777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1048  CoA-binding domain-containing protein  34.81 
 
 		 139 aa  77  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.417839  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0216  CoA-binding domain-containing protein  37.41 
 
 		 148 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.583097  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2690  CoA-binding domain protein  33.08 
 
 		 198 aa  76.6  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3103  hypothetical protein  35.56 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.210422  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3783  CoA-binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.118065  normal  0.110814 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1672  CoA-binding protein  36.09 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00996781  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1014  CoA-binding domain protein  35.29 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1562  CoA-binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 139 aa  75.9  0.0000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.477139  normal  0.0705808 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2417  CoA-binding domain protein  33.83 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.452114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0222  CoA-binding protein  39.71 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.388351  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0687  CoA-binding domain-containing protein  35.07 
 
 		 138 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.44778  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2545  hypothetical protein  34.11 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2574  hypothetical protein  33.82 
 
 		 161 aa  74.3  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.624453  hitchhiker  0.000000425683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1379  CoA-binding domain protein  34.62 
 
 		 161 aa  74.7  0.0000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419725 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1630  CoA-binding domain protein  30.83 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0982  CoA-binding domain-containing protein  34.35 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.419448 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0211  CoA-binding protein  38.97 
 
 		 150 aa  73.9  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1875  CoA-binding domain protein  29.32 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.948163 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2622  CoA-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3207  CoA-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0196992  normal  0.0308168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2533  CoA-binding domain-containing protein  31.58 
 
 		 138 aa  73.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0861335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>