28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2938 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2938  hypothetical protein  100 
 
 		 277 aa  565  1e-160  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.131158 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1998  hypothetical protein  64.71 
 
 		 272 aa  350  2e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.343248  normal  0.497208 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1492  hypothetical protein  56.04 
 
 		 277 aa  293  1e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000942268  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0377  exonuclease-like protein  46.18 
 
 		 277 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0240819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0916  hypothetical protein  48.47 
 
 		 281 aa  235  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.58478  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1466  hypothetical protein  40.5 
 
 		 253 aa  191  2e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.330036  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1643  exonuclease  36.4 
 
 		 287 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1749  hypothetical protein  36.67 
 
 		 249 aa  170  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.873614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3322  hypothetical protein  36.17 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.640216  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1457  hypothetical protein  38.82 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1783  hypothetical protein  37.19 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.184707 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1716  hypothetical protein  36.17 
 
 		 250 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4370  hypothetical protein  34.1 
 
 		 267 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4347  hypothetical protein  33.72 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4215  hypothetical protein  33.72 
 
 		 267 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105075  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1001  hypothetical protein  37.45 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4364  hypothetical protein  35 
 
 		 301 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.015731  normal  0.163667 
 
 
-
 
NC_002936  DET1404  hypothetical protein  40.26 
 
 		 165 aa  87.4  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000594645  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1213  exonuclease-like protein  38.96 
 
 		 162 aa  85.1  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.00000000173216  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1709  hypothetical protein  37.04 
 
 		 164 aa  84.7  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000629582  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1186  hypothetical protein  38.96 
 
 		 165 aa  84.3  0.000000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000107945  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2632  exonuclease-like protein  38.67 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3041  exonuclease-like protein  36 
 
 		 168 aa  74.7  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3223  exonuclease-like protein  35.5 
 
 		 168 aa  74.7  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000951035  normal  0.223886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2961  exonuclease-like protein  31.9 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0548295  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2731  hypothetical protein  26.67 
 
 		 361 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3121  hypothetical protein  32.26 
 
 		 414 aa  45.8  0.0009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1330  exonuclease-like protein  32.26 
 
 		 392 aa  43.9  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000156681  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>