18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2668 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2668  type IV pilus assembly PilZ  100 
 
 		 236 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0801155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2940  hypothetical protein  50.45 
 
 		 222 aa  236  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2273  type IV pilus assembly PilZ  47.27 
 
 		 223 aa  198  5e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0573  type IV pilus assembly PilZ  28.77 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.960083  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1127  type IV pilus assembly PilZ  28.04 
 
 		 214 aa  92.8  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01915  hypothetical protein  29.33 
 
 		 227 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.429249  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0848  hypothetical protein  25.68 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.10808  normal  0.09437 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0992  hypothetical protein  25.68 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.286379 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2388  type IV pilus assembly PilZ  24.77 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05354  hypothetical protein  26.32 
 
 		 220 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0292  hypothetical protein  22.77 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000146713  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3596  type IV pilus assembly PilZ  22.54 
 
 		 220 aa  53.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0672  hypothetical protein  28.7 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3582  hypothetical protein  32 
 
 		 236 aa  47  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1957  hypothetical protein  24.41 
 
 		 309 aa  45.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0091  hypothetical protein  25.21 
 
 		 252 aa  42.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000127543  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1416  type IV pilus assembly PilZ  20.73 
 
 		 225 aa  42.7  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.689221 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0707  type IV pilus assembly PilZ  25.87 
 
 		 222 aa  42  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>