241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2235 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  100 
 
 
350 aa  710    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  84.86 
 
 
350 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  75 
 
 
355 aa  511  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0191  translation initiation factor, aIF-2BI family  69.3 
 
 
348 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  66.47 
 
 
378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  61.85 
 
 
350 aa  423  1e-117  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  54.49 
 
 
346 aa  362  6e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.16 
 
 
342 aa  361  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  55.12 
 
 
354 aa  359  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  54.82 
 
 
343 aa  354  2e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  54.82 
 
 
343 aa  354  2e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  52.52 
 
 
350 aa  349  4e-95  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  52.38 
 
 
349 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  57.88 
 
 
344 aa  340  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  54.52 
 
 
354 aa  339  2.9999999999999998e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  53.05 
 
 
346 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  51.82 
 
 
342 aa  333  3e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  53.03 
 
 
346 aa  332  4e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.61 
 
 
346 aa  332  6e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  53.03 
 
 
346 aa  328  8e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  53.5 
 
 
355 aa  328  8e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  50 
 
 
337 aa  317  2e-85  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.45 
 
 
369 aa  315  5e-85  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.05 
 
 
346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  51.69 
 
 
346 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.05 
 
 
346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.48 
 
 
358 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  56.27 
 
 
345 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.8 
 
 
348 aa  308  8e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.64 
 
 
351 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  49.85 
 
 
345 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  47.58 
 
 
323 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.6 
 
 
350 aa  305  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  50.6 
 
 
350 aa  305  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  52.27 
 
 
346 aa  305  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.75 
 
 
354 aa  305  1.0000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  49.71 
 
 
352 aa  304  1.0000000000000001e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  51.04 
 
 
349 aa  304  2.0000000000000002e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  49.09 
 
 
321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  47.65 
 
 
346 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  51.06 
 
 
348 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0169  aIF-2BI family translation initiation factor  47.04 
 
 
345 aa  302  7.000000000000001e-81  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00178496 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.02 
 
 
350 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50.15 
 
 
354 aa  301  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  48.18 
 
 
321 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  51.34 
 
 
337 aa  299  4e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  48.48 
 
 
321 aa  299  4e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.36 
 
 
357 aa  299  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  52.74 
 
 
345 aa  298  7e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.35 
 
 
354 aa  298  7e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.53 
 
 
344 aa  295  9e-79  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1036  translation initiation factor, aIF-2BI family  49.71 
 
 
347 aa  295  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.313313  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.17 
 
 
347 aa  293  3e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  47.59 
 
 
358 aa  293  3e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.08 
 
 
353 aa  290  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  49.84 
 
 
332 aa  289  5.0000000000000004e-77  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  50.16 
 
 
334 aa  289  6e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.41 
 
 
348 aa  288  8e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  51.03 
 
 
354 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.53 
 
 
332 aa  287  2e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  47.88 
 
 
344 aa  286  5e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  47.92 
 
 
349 aa  285  9e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.41 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.08 
 
 
350 aa  285  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  44.44 
 
 
347 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50 
 
 
349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  50 
 
 
349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.37 
 
 
329 aa  283  5.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.55 
 
 
347 aa  281  8.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.83 
 
 
348 aa  281  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.81 
 
 
348 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.81 
 
 
348 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.81 
 
 
347 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  46.76 
 
 
348 aa  280  2e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.21 
 
 
348 aa  281  2e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.81 
 
 
348 aa  279  4e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.59 
 
 
348 aa  280  4e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.57 
 
 
356 aa  280  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  48.15 
 
 
353 aa  279  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.99 
 
 
349 aa  279  6e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2579  methylthioribose-1-phosphate isomerase  51.05 
 
 
354 aa  279  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  48.35 
 
 
348 aa  278  8e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  43.73 
 
 
328 aa  278  1e-73  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  48.02 
 
 
327 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  49.09 
 
 
351 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.37 
 
 
358 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1289  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.82 
 
 
364 aa  276  5e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0889723  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3648  methylthioribose-1-phosphate isomerase  49.85 
 
 
365 aa  275  8e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.295966  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.37 
 
 
358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4317  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.04 
 
 
339 aa  273  3e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4186  translation initiation factor 2B subunit I  52.58 
 
 
339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4339  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.04 
 
 
339 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1694  aIF-2BI family translation initiation factor  45.22 
 
 
353 aa  272  7e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.85 
 
 
353 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2293  initiation factor 2B alpha/beta/delta  50.6 
 
 
348 aa  271  1e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.65 
 
 
358 aa  271  1e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1744  initiation factor 2 subunit family  49.27 
 
 
358 aa  271  2e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  48.35 
 
 
351 aa  270  4e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2033  aIF-2BI family translation initiation factor  42.77 
 
 
354 aa  268  1e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0573  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  50.59 
 
 
354 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>