181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_R0024 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_R0024  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.330999  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0042  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00104158  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0019  tRNA-Lys  95.45 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000484995  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0021  tRNA-Lys  95.45 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0037  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000296875  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0035  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 76 bp  95.6  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0037  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000966044  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0067  tRNA-Lys  90 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0804329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0001  tRNA-Lys  90.62 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0052  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000241961  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0034  tRNA-Lys  88.16 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0039  tRNA-Gln  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0019  tRNA-Lys  86.84 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0039  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0040  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0026  tRNA-Lys  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000388812  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28780  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.140061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0031  tRNA-Lys  93.48 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0048  tRNA-Lys  93.48 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.514987  normal  0.0153683 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0020  tRNA-Lys  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.789057  hitchhiker  0.000213663 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0062  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.209249  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0025  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0025  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.48259e-19 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0037  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0220661  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  85.53 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0050  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t36  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0048  tRNA-Asn  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.667802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0043  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.438786  normal  0.486369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0026  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000756326  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0039  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0022  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0061  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0023  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75812  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0030  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0471674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0044  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0031  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0015  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0792154  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.489322  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00236112  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_722  tRNA-Lys  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0034  tRNA-Lys  87.69 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0762298  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0044  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0696319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08800  tRNA-Lys  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0702581  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0023  tRNA-Lys  84.93 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.299591  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0026  tRNA-Lys  85.51 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000013123  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  84.21 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0049  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000660852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0056  tRNA-Lys  100 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0008  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0021  tRNA-Lys  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0008  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0037  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0013  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0046  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000144311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0042  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000336952  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0050  tRNA-Lys  88.24 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.016026  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0043  tRNA-Lys  84.51 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102089  hitchhiker  0.00032415 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0023  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0012  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017213  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.047659  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0021  tRNA-Lys  89.13 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0223397 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0028  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0051  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0078  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0983786 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0027  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2619  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0471247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2626  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2305  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2312  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112802  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0021  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0046  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0640461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0040  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0021  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0051  tRNA-Asn  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0050  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0082  tRNA-Lys  84.29 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000538289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0020  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.405575 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0107  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000354885  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0108  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000399155  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0022  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462625  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_778  tRNA-Lys  86.21 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  90.24 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0037  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205438  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0028  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0172  tRNA-Arg  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.678062  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0034  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.285979  normal  0.935784 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0038  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0037  tRNA-Thr  85.96 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0034  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0063  tRNA-Lys  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14030  tRNA-Lys  88.89 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.36075e-34  hitchhiker  0.0017768 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0047  tRNA-Lys  84.06 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.101191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>