39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_R0039 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_R0039  tRNA-Gln  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0024  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.330999  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0019  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000484995  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0021  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000445205  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0023  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0042  tRNA-Lys  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000336952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0042  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00104158  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0039  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28780  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.140061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0031  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 73 bp  54  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0037  tRNA-Lys  90.7 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000296875  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0040  tRNA-Lys  87.27 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0008  tRNA-Lys  85 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0034  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0019  tRNA-Lys  85.71 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475559  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0022  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0020  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.789057  hitchhiker  0.000213663 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0015  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0792154  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0043  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.438786  normal  0.486369 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0031  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0026  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000756326  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0044  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08800  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0702581  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0043  tRNA-Lys  100 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122965  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0030  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0471674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0039  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0048  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.514987  normal  0.0153683 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0052  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000241961  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14025  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0023  tRNA-Lys  85.45 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75812  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0013  tRNA-Lys  88.37 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0056  tRNA-Lys  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.489322  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0046  tRNA-Gln  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103018  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_722  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0023  tRNA-Lys  84.48 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.299591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0009  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.190028  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0008  tRNA-Arg  88.1 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.119735  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0059  tRNA-Arg  86.96 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.673271  normal  0.352289 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>