More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_R0039 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_R0039  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0030  tRNA-Lys  98.63 
 
 		 76 bp  137  4e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0471674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0013  tRNA-Lys  96.05 
 
 		 75 bp  119  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.882004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0023  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 76 bp  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t36  tRNA-Lys  92.11 
 
 		 76 bp  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0042  tRNA-Lys  93.42 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000336952  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0025  tRNA-Lys  94.83 
 
 		 76 bp  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0043  tRNA-Lys  90.79 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000122965  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0019  tRNA-Lys  94.64 
 
 		 76 bp  87.7  3e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475559  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0037  tRNA-Lys  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0025  tRNA-Lys  94.55 
 
 		 76 bp  85.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.48259e-19 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0034  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0035  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.206932  normal  0.941173 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  90.32 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0044  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0696319 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0030  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.455261  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0029  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379837  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5576  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5317200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0297  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5654  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0194  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000250761  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 79 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0275  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5728  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000897911  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0063  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0021  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160361  normal  0.0210498 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0016  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000293232  hitchhiker  0.00358578 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0173  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0567172 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5018  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00214823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5833  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4987  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0781  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66086e-30 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5670  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000995233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0027  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789161  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0040  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0001  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0044  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.489322  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_722  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0023  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.299591  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0037  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000296875  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0001  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  90.74 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0101  tRNA-Thr  90.74 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0037  tRNA-Lys  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000966044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0078  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0983786 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0050  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0060  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00479449  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0030  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0025  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.949692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0026  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0061  tRNA-Lys  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00229063  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5046  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4575  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>