More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_R0037 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_R0037  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.663839  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0078  tRNA-Lys  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0983786 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0025  tRNA-Lys  96.05 
 
 
76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416946  unclonable  9.48259e-19 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0030  tRNA-Lys  95.83 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0025  tRNA-Lys  95.83 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.949692  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0026  tRNA-Lys  95.83 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0060  tRNA-Lys  95.83 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00479449  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0061  tRNA-Lys  95.83 
 
 
76 bp  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00229063  normal  0.168783 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0027  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.789161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0044  tRNA-Lys  92.11 
 
 
76 bp  103  6e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0036  tRNA-Ser  97.96 
 
 
72 bp  89.7  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0022  tRNA-Lys  90.41 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0019  tRNA-Lys  94.74 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475559  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0060  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0060  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.845098  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0021  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.682911  normal  0.0277835 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0031  tRNA-Lys  91.18 
 
 
73 bp  87.7  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.640405  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0026  tRNA-Lys  91.18 
 
 
73 bp  87.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000756326  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna43  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0022  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0195324  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0023  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.75812  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0015  tRNA-Lys  91.18 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0792154  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0039  tRNA-Lys  94.55 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0030  tRNA-Lys  94.55 
 
 
76 bp  85.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0471674  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0022  tRNA-Lys  89.19 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00514969  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0039  tRNA-Lys  89.19 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0040  tRNA-Lys  89.19 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t36  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0027  tRNA-Lys  89.19 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0040  tRNA-Lys  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0028  tRNA-Lys  89.19 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0001  tRNA-Lys  93.1 
 
 
76 bp  83.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0046  tRNA-Lys  89.86 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0021  tRNA-Lys  89.04 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0029  tRNA-Lys  89.86 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000384489  normal  0.924155 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0063  tRNA-Lys  89.86 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0022  tRNA-Lys  89.04 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.462625  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0034  tRNA-Lys  92.86 
 
 
76 bp  79.8  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28780  tRNA-Lys  89.71 
 
 
73 bp  79.8  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.140061 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0056  tRNA-Lys  89.47 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0051  tRNA-Lys  94.55 
 
 
75 bp  77.8  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.106867  normal  0.0466921 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0029  tRNA-Lys  92.73 
 
 
76 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.379837  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0030  tRNA-Lys  92.73 
 
 
73 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.455261  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0194  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000250761  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0023  tRNA-Lys  88.57 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.051511  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  87.84 
 
 
79 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5728  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000897911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  87.84 
 
 
78 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0781  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66086e-30 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5576  tRNA-Lys  87.84 
 
 
78 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5317200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08800  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0702581  normal  0.0577684 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0173  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0567172 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5018  tRNA-Lys  87.84 
 
 
78 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00214823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  87.84 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5654  tRNA-Lys  87.84 
 
 
78 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664356  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4987  tRNA-Lys  87.84 
 
 
78 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5833  tRNA-Lys  87.84 
 
 
78 bp  75.8  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233495  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0048  tRNA-Lys  88.57 
 
 
76 bp  75.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.514987  normal  0.0153683 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0025  tRNA-Lys  91.23 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0012  tRNA-Lys  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0011  tRNA-Lys  92.45 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0275  tRNA-Lys  88.24 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  88.24 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  88.24 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  88.24 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  88.24 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  88.24 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0047  tRNA-Lys  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.787632  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0057  tRNA-Lys  97.5 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000681091  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  88.24 
 
 
73 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0297  tRNA-Lys  88.24 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0075  tRNA-Lys  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>