242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0929 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0929  translation initiation factor, aIF-2BI family  100 
 
 
344 aa  698    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.119435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1360  translation initiation factor, aIF-2BI family  54.39 
 
 
342 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0559648  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2064  aIF-2BI family translation initiation factor  52.2 
 
 
346 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000777983  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  52.54 
 
 
343 aa  345  4e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.339634  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0016  aIF-2BI family translation initiation factor  52.54 
 
 
343 aa  345  4e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.570831  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0518  aIF-2BI family translation initiation factor  53.03 
 
 
334 aa  336  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.294825  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_459  methylthioribose-1-phosphate isomerase  52.42 
 
 
332 aa  335  9e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.14852  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0779  S-methyl-5-thioribose-1-phosphate isomerase  50.45 
 
 
346 aa  331  9e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.404257  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1519  aIF-2BI family translation initiation factor  50.44 
 
 
350 aa  331  1e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.889993  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0621  translation initiation factor 2B subunit I  50 
 
 
342 aa  331  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0997628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4322  aIF-2BI family translation initiation factor  50 
 
 
346 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.394096  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0964  translation initiation factor, aIF-2BI family  51.62 
 
 
351 aa  329  4e-89  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.518904  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0072  translation initiation factor 2B subunit I  50.59 
 
 
346 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.25912 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0494  translation initiation factor 2B subunit I  51.96 
 
 
332 aa  327  1.0000000000000001e-88  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.93452  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3379  aIF-2BI family translation initiation factor  49.7 
 
 
346 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0648  aIF-2BI family translation initiation factor  48.39 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1186  translation initiation factor, aIF-2BI family  53.49 
 
 
345 aa  327  3e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000144196  normal  0.031954 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0254  aIF-2BI family translation initiation factor  49.71 
 
 
346 aa  326  3e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2078  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.96 
 
 
353 aa  326  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.424406 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0510  aIF-2BI family translation initiation factor  49.41 
 
 
346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3749  putative translation initiation factor, aIF-2BI/5-methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.86 
 
 
354 aa  320  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0999  aIF-2BI family translation initiation factor  50.3 
 
 
327 aa  320  3e-86  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.260098  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1647  translation initiation factor, aIF-2BI family  50.61 
 
 
329 aa  318  9e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3560  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.43 
 
 
357 aa  317  3e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2269  translation initiation factor 2B subunit I  48.69 
 
 
349 aa  315  7e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4687  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.75 
 
 
350 aa  315  9e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1175  translation initiation factor 2B subunit I  46.94 
 
 
354 aa  314  9.999999999999999e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0810  aIF-2BI family translation initiation factor  49.71 
 
 
349 aa  312  4.999999999999999e-84  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2349  aIF-2BI family translation initiation factor  45.86 
 
 
358 aa  312  5.999999999999999e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.944221  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1643  translation initiation factor  46.87 
 
 
344 aa  311  1e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.226672  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0676  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.83 
 
 
339 aa  310  2e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0103604  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1381  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.98 
 
 
362 aa  310  2.9999999999999997e-83  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.705402  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3544  methylthioribose-1-phosphate isomerase  46.25 
 
 
347 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3596  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.63 
 
 
346 aa  309  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1881  aIF-2BI family translation initiation factor  50 
 
 
345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0419  translation initiation factor 2B subunit I family (IF-2BI)  44.97 
 
 
347 aa  306  3e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.04546  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0319  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.38 
 
 
347 aa  306  5.0000000000000004e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0441  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.08 
 
 
348 aa  305  6e-82  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0332  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.08 
 
 
348 aa  305  7e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0379  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.08 
 
 
348 aa  305  7e-82  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0347  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.08 
 
 
347 aa  305  8.000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4924  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.08 
 
 
348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.64519  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0327  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.08 
 
 
348 aa  303  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1491  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.1 
 
 
353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.626941  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0485  aIF-2BI family translation initiation factor  48.52 
 
 
353 aa  303  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.646058  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0394  methylthioribose-1-phosphate isomerase  48.08 
 
 
348 aa  302  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2613  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.04 
 
 
349 aa  302  5.000000000000001e-81  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4334  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  46.53 
 
 
337 aa  302  7.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0316  methylthioribose-1-phosphate isomerase  47.79 
 
 
348 aa  301  8.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0503  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.08 
 
 
350 aa  300  2e-80  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3816  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.95 
 
 
350 aa  300  2e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.732544 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0595  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.06 
 
 
328 aa  298  8e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3646  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.68 
 
 
346 aa  297  2e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0156  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  47.65 
 
 
354 aa  297  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3753  translation initiation factor, aIF-2BI family  48.39 
 
 
346 aa  296  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0703  translation initiation factor 2B subunit I  50.44 
 
 
351 aa  295  5e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000787843 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6765  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.53 
 
 
369 aa  295  6e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2235  translation initiation factor, aIF-2BI family  46.53 
 
 
350 aa  295  9e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18480  putative translation initiation factor, aIF-2BI family  47.25 
 
 
355 aa  294  1e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0224403  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1783  translation initiation factor, aIF-2BI family  44 
 
 
353 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3765  translation initiation factor, aIF-2BI family  47.51 
 
 
345 aa  294  2e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0692423  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2312  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.67 
 
 
378 aa  292  7e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1791  translation initiation factor 2B subunit I  50.15 
 
 
321 aa  291  1e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1844  initiation factor 2B alpha/beta/delta  44.18 
 
 
335 aa  291  2e-77  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0865  aIF-2BI family translation initiation factor  50.15 
 
 
321 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0114166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15800  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.87 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1203  translation initiation factor, aIF-2BI family  42.9 
 
 
358 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178333 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4139  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.16 
 
 
353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.196624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1099  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.87 
 
 
353 aa  288  7e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.767768 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0076  translation initiation factor 2B subunit I  46.99 
 
 
355 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4159  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.28 
 
 
351 aa  287  2e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.109098  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0893  translation initiation factor, putative, aIF-2BI family  45.09 
 
 
350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.592347  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1015  translation initiation factor, aIF-2BI family  45.09 
 
 
350 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.253315  unclonable  0.0000000000388932 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0027  aIF-2BI family translation initiation factor  47.67 
 
 
337 aa  285  7e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3942  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.38 
 
 
351 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3789  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.99 
 
 
351 aa  285  9e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.700016  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4251  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.38 
 
 
351 aa  285  9e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4098  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.28 
 
 
351 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463174  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0846  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.43 
 
 
356 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4053  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.99 
 
 
351 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3774  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.99 
 
 
351 aa  283  2.0000000000000002e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2170  aIF-2BI family translation initiation factor  47.21 
 
 
344 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1052  aIF-2BI family translation initiation factor  48.94 
 
 
321 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3861  methylthioribose-1-phosphate isomerase  44.57 
 
 
349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.583783  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1706  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  43.53 
 
 
349 aa  283  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.307709  normal  0.360385 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2877  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized proteins  45.76 
 
 
350 aa  282  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1534  translation initiation factor, aIF-2BI family  44.18 
 
 
348 aa  282  6.000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2717  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.35 
 
 
349 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.143544  normal  0.136837 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1992  translation initiation factor 2B subunit I  40.99 
 
 
348 aa  282  7.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3396  methylthioribose-1-phosphate isomerase  45.35 
 
 
349 aa  282  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1960  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.39 
 
 
358 aa  281  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23250  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.68 
 
 
358 aa  280  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0078361 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2493  eIF-2B alpha/beta/delta-related uncharacterized protein  44.81 
 
 
351 aa  281  2e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4079  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.68 
 
 
358 aa  279  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1944  translation initiation factor 2B subunit I  44.35 
 
 
352 aa  279  4e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00466755  normal  0.570212 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2043  methylthioribose-1-phosphate isomerase  43.24 
 
 
354 aa  279  6e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00735  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.48 
 
 
354 aa  279  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0927  aIF-2BI family translation initiation factor  48.64 
 
 
323 aa  277  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2124  methylthioribose-1-phosphate isomerase  42.94 
 
 
354 aa  277  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.369854  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1840  aIF-2BI family translation initiation factor  47.72 
 
 
348 aa  277  2e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635739  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>