94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0170 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_0170  Polysulphide reductase NrfD  100 
 
 		 378 aa  750    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1198  Polysulphide reductase NrfD  59.52 
 
 		 400 aa  450  1e-125  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1116  polysulphide reductase, NrfD  65.16 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0461  putative hydrogenase cytochrome b subunit  64 
 
 		 381 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0292  Polysulphide reductase NrfD  56.68 
 
 		 396 aa  422  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.468469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4619  Polysulphide reductase NrfD  58.6 
 
 		 416 aa  404  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1578  putative hydrogenase cytochrome b subunit  44.92 
 
 		 394 aa  319  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.534156  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1044  putative hydrogenase cytochrome b subunit  44.62 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0160  polysulphide reductase, NrfD  45.36 
 
 		 402 aa  309  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2602  polysulphide reductase, NrfD  38.92 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1957  Polysulphide reductase NrfD  39.57 
 
 		 403 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2265  Polysulphide reductase NrfD  39.45 
 
 		 403 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3972  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  37.57 
 
 		 386 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.158247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1061  polysulphide reductase, NrfD  36.74 
 
 		 401 aa  226  6e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.079733 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0779  formate dehydrogenase, b-type cytochrome subunit, putative  38.07 
 
 		 401 aa  225  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4090  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.88 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194025  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3386  polysulphide reductase, NrfD  34.89 
 
 		 403 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1801  polysulphide reductase NrfD  37.33 
 
 		 408 aa  212  9e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2252  polysulphide reductase NrfD  37.5 
 
 		 402 aa  210  3e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.38952  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1957  Polysulphide reductase NrfD  36.12 
 
 		 403 aa  210  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0356047  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1872  Polysulphide reductase NrfD  36.12 
 
 		 403 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2006  polysulphide reductase, NrfD  36.49 
 
 		 403 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2407  polysulphide reductase, NrfD  34.82 
 
 		 388 aa  199  7e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3137  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  33.76 
 
 		 446 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0875  Polysulphide reductase NrfD  35.51 
 
 		 402 aa  193  3e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.946275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1125  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.74 
 
 		 435 aa  193  4e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2040  Polysulphide reductase NrfD  33.33 
 
 		 404 aa  192  6e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.918159  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0146  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30.94 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3464  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.42 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3422  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.42 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2596  Polysulphide reductase NrfD  34.12 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2504  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  35.73 
 
 		 382 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.130941 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4307  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.15 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3281  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.15 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0698  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.15 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3175  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  34.15 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02871  predicted hydrogenase 2 cytochrome b type component  34.15 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02820  hypothetical protein  34.15 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0701  Polysulphide reductase NrfD  34.15 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0651  hmc operon protein 3  33.33 
 
 		 389 aa  186  8e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.958991  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_175  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase membrane subunit  32.03 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.100817  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0166  polysulphide reductase, NrfD  31.75 
 
 		 403 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.391929  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0186  formate dehydrogenase, membrane subunit, putative  32.03 
 
 		 403 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3330  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  33.6 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.353265  normal  0.837141 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3321  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  33.6 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.437559  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3496  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  33.6 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.426978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3395  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  33.6 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.522703 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3401  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  33.6 
 
 		 392 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1945  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.72 
 
 		 438 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0570  Polysulphide reductase NrfD  33.59 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2943  polysulphide reductase, NrfD  33.42 
 
 		 394 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.486448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3521  polysulphide reductase NrfD  33.33 
 
 		 405 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.538127  normal  0.625626 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0784  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  31.06 
 
 		 442 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.242896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3524  polysulphide reductase NrfD  34.48 
 
 		 401 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.902311  normal  0.369035 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3042  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 744 aa  166  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0507  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30 
 
 		 415 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0512  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  29.74 
 
 		 415 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1412  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  33.24 
 
 		 399 aa  161  1e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1984  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30.75 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00764136  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0479  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  29.74 
 
 		 415 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.304039  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2532  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  32.4 
 
 		 399 aa  157  3e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.346938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2087  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  31.54 
 
 		 731 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2236  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  30.25 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.263965 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1790  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.54 
 
 		 731 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1869  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.54 
 
 		 731 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.856186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0455  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  30.42 
 
 		 729 aa  149  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.453465 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0524  putative hydrogenase 2 b cytochrome subunit  28.97 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.920848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0664  polysulphide reductase-like protein  28.27 
 
 		 451 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2935  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  31.01 
 
 		 418 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.52066  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0677  polysulphide reductase-like protein  28.21 
 
 		 451 aa  127  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.56556e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3654  polysulphide reductase-like protein  30.58 
 
 		 465 aa  124  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.731183  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2271  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  28.57 
 
 		 419 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1704  polysulphide reductase-like protein  28.73 
 
 		 443 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.990037  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2687  Polysulphide reductase NrfD  27.39 
 
 		 417 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.046719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4239  nickel-dependent hydrogenase, membrane protein  27.44 
 
 		 443 aa  113  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0273  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  27.59 
 
 		 409 aa  111  3e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2549  polysulphide reductase NrfD  29.73 
 
 		 410 aa  104  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3393  Polysulphide reductase NrfD  26.86 
 
 		 411 aa  104  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0608  molybdopterin oxidoreductase, transmembrane subunit, putative  24.4 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0543645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3666  Polysulphide reductase NrfD  23.2 
 
 		 380 aa  64.3  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.396142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4225  Polysulphide reductase NrfD  22.32 
 
 		 389 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000782128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0451  Polysulphide reductase NrfD  24 
 
 		 445 aa  54.7  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2523  Polysulphide reductase NrfD  25.13 
 
 		 416 aa  53.1  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2436  Polysulphide reductase NrfD  26.23 
 
 		 416 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.136872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4229  Polysulphide reductase NrfD  24.41 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02130  polysulphide reductase  22.11 
 
 		 389 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4045  polysulfide reductase, subunit C  22.47 
 
 		 313 aa  48.9  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1867  Polysulphide reductase NrfD  23.36 
 
 		 411 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0715566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1424  polysulphide reductase, NrfD  25.68 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1798  Polysulphide reductase NrfD  25.32 
 
 		 391 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2775  polysulphide reductase, NrfD  23.95 
 
 		 472 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0295745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1631  Polysulphide reductase NrfD  22.81 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3262  Polysulphide reductase NrfD  24.34 
 
 		 442 aa  43.5  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0389204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2406  polysulphide reductase NrfD  23.06 
 
 		 417 aa  43.1  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.148885  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>