139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0075 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 
289 aa  584  1e-166  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  50.58 
 
 
271 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  48.46 
 
 
254 aa  228  9e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  45.14 
 
 
255 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  30.07 
 
 
331 aa  101  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  29.84 
 
 
330 aa  99.8  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  31.89 
 
 
334 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  32.37 
 
 
262 aa  97.8  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  29.26 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  31.09 
 
 
335 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  31.16 
 
 
337 aa  88.2  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  30.31 
 
 
333 aa  88.2  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  29.23 
 
 
330 aa  86.3  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  27.76 
 
 
331 aa  84.3  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  28.46 
 
 
331 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  26.97 
 
 
331 aa  80.5  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  30.12 
 
 
257 aa  80.5  0.00000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  29.93 
 
 
334 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  26.48 
 
 
331 aa  72.8  0.000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  28.11 
 
 
255 aa  72  0.00000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  27.08 
 
 
342 aa  72  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  28.11 
 
 
256 aa  72  0.00000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  29.69 
 
 
233 aa  71.2  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  28.31 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  27.14 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  29.61 
 
 
249 aa  68.6  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.53 
 
 
233 aa  67.4  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  27.88 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.51 
 
 
225 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.51 
 
 
225 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1827  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.41 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.259695  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.61 
 
 
225 aa  58.5  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  26.19 
 
 
339 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  24.03 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5005  respiratory nitrate reductase gamma subunit  23.83 
 
 
227 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.144628  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26 
 
 
225 aa  57.4  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  25.81 
 
 
225 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  27.19 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0977  respiratory nitrate reductase transmembrane protein  25.7 
 
 
227 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.376646 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.5 
 
 
235 aa  54.7  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  27.39 
 
 
220 aa  53.5  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.44 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.68 
 
 
254 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1228  nitrate reductase, gamma subunit  28.45 
 
 
255 aa  53.1  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.81 
 
 
242 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4592  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.91 
 
 
239 aa  52.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2631  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.58 
 
 
225 aa  52.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997723  normal  0.0188377 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.15 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.89 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.69 
 
 
254 aa  51.6  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.75 
 
 
229 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.87 
 
 
225 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  25.87 
 
 
225 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  25.87 
 
 
225 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  25.87 
 
 
225 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.87 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.69 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2795  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.48 
 
 
244 aa  50.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2077  respiratory nitrate reductase subunit gamma  26.17 
 
 
227 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0152156  normal  0.186259 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0439  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.83 
 
 
244 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00872281  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.64 
 
 
225 aa  50.8  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  22.87 
 
 
228 aa  50.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13830  respiratory nitrate reductase gamma chain  27.59 
 
 
227 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.792747  normal  0.19596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1237  respiratory nitrate reductase gamma chain  27.59 
 
 
227 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.928903  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.92 
 
 
234 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.66 
 
 
229 aa  49.7  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.55 
 
 
229 aa  49.3  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  22.87 
 
 
229 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  22.87 
 
 
229 aa  49.3  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  22.87 
 
 
229 aa  49.3  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1921  Nitrate reductase  23.45 
 
 
240 aa  48.9  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.69 
 
 
229 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.13 
 
 
234 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0430  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.31 
 
 
244 aa  48.9  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.657074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3598  nitrite transporter  30.13 
 
 
699 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0417643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01205  nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit  25.87 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.372615  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.87 
 
 
225 aa  48.1  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01215  hypothetical protein  25.87 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  29.15 
 
 
248 aa  47.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1584  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.74 
 
 
238 aa  47.8  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000863008  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1337  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.87 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180394  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1378  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.87 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653452  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2396  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.87 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000178622 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1912  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  25.87 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0870039  normal  0.196031 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1395  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  25.87 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1711  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  25.87 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.163334  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1758  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  25.1 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351215  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1697  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  25.1 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.230507 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1581  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  25.1 
 
 
226 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.214627  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.21 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  23.83 
 
 
239 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2037  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.53 
 
 
233 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1286  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25 
 
 
243 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.65257  normal  0.0385137 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.69 
 
 
234 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.21 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.86 
 
 
225 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.88 
 
 
231 aa  47  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3672  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.83 
 
 
243 aa  47  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.167763  normal  0.110852 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  23.81 
 
 
248 aa  46.6  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2159  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.89 
 
 
243 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817555 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>