76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1535 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 		 262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  32.64 
 
 		 271 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  29.23 
 
 		 249 aa  99.4  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  32.37 
 
 		 289 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 255 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  31.65 
 
 		 254 aa  90.5  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  28.52 
 
 		 332 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  29.77 
 
 		 244 aa  77.8  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  27.67 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  26.67 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  31.45 
 
 		 255 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  27.78 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  27.34 
 
 		 331 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  27.55 
 
 		 331 aa  75.9  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  27.49 
 
 		 331 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  28.64 
 
 		 233 aa  75.1  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  26.84 
 
 		 334 aa  72  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  27.07 
 
 		 331 aa  71.2  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  28.19 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  27.08 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  27.06 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  26.49 
 
 		 302 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  28.7 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  28.49 
 
 		 302 aa  65.5  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.69 
 
 		 233 aa  65.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  25.19 
 
 		 337 aa  61.6  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  27.91 
 
 		 335 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  25.95 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  27.27 
 
 		 299 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  25.66 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  31.56 
 
 		 248 aa  58.5  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  26.22 
 
 		 342 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  28.57 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  25.65 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  28.14 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.98 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.18 
 
 		 254 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1445  nitrate reductase, gamma subunit  24.02 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.9 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03844  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.71 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1228  nitrate reductase, gamma subunit  28.14 
 
 		 255 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.38 
 
 		 234 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  29.41 
 
 		 339 aa  52.4  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.79 
 
 		 255 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.32 
 
 		 254 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1208  respiratory nitrate reductase gamma subunit  33.53 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.787753  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.91 
 
 		 240 aa  50.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0180  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.94 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.363972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3141  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.47 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.172601  hitchhiker  0.0025253 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.37 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.37 
 
 		 225 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.06 
 
 		 229 aa  46.2  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.34 
 
 		 254 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  26.79 
 
 		 229 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.09 
 
 		 234 aa  45.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2806  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.33 
 
 		 248 aa  45.8  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.460402  normal  0.0323748 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0669  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.05 
 
 		 241 aa  45.8  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0113371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  23.53 
 
 		 231 aa  45.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.32 
 
 		 229 aa  45.8  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.89 
 
 		 234 aa  45.4  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.35 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.56 
 
 		 227 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.19 
 
 		 233 aa  45.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2229  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.56 
 
 		 227 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125271  normal  0.0229196 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  25.75 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  25.75 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0840  Nitrate reductase gamma subunit  22.27 
 
 		 312 aa  43.5  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000098802  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  25.75 
 
 		 229 aa  43.9  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.88 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0608  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.11 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.15 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1974  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.26 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2632  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  22.41 
 
 		 230 aa  42.7  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3867  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.26 
 
 		 257 aa  42.7  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  22.18 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  24.54 
 
 		 242 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>