70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0451 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 		 339 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  61.83 
 
 		 335 aa  433  1e-120  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  62.43 
 
 		 334 aa  428  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  60.18 
 
 		 334 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  52.6 
 
 		 332 aa  338  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  49.4 
 
 		 331 aa  336  2.9999999999999997e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  51.59 
 
 		 330 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  50.61 
 
 		 330 aa  326  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  46.22 
 
 		 333 aa  323  2e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  49.7 
 
 		 331 aa  322  4e-87  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  48.18 
 
 		 331 aa  319  3e-86  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  49.38 
 
 		 337 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  46.41 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  48.53 
 
 		 342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  45.15 
 
 		 331 aa  306  4.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  46.97 
 
 		 331 aa  297  2e-79  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  45.45 
 
 		 332 aa  292  5e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  36.27 
 
 		 249 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  34.78 
 
 		 233 aa  142  7e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  33.1 
 
 		 255 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  31.73 
 
 		 244 aa  118  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  31.49 
 
 		 248 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  27.14 
 
 		 271 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  27.61 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  29.48 
 
 		 255 aa  62.8  0.000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  28.9 
 
 		 256 aa  60.8  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  23.23 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  28.79 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  39.45 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.55 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2703  respiratory nitrate reductase gamma subunit  25.93 
 
 		 234 aa  55.1  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.304029  normal  0.077943 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  23.98 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  25.22 
 
 		 277 aa  51.2  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.23 
 
 		 233 aa  51.6  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  23.98 
 
 		 302 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1000  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.21 
 
 		 231 aa  51.2  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.54 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  27.68 
 
 		 225 aa  49.3  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.33 
 
 		 234 aa  49.7  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2880  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.17 
 
 		 225 aa  48.9  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1892  respiratory nitrate reductase subunit gamma  28.32 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.644939  normal  0.075518 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1956  respiratory nitrate reductase subunit gamma  28.32 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.817539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1897  respiratory nitrate reductase subunit gamma  28.32 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.017842  normal  0.804398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1562  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.32 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.995386 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1379  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.41 
 
 		 225 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.477496  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.95 
 
 		 233 aa  48.1  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.22 
 
 		 229 aa  48.5  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2229  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.4 
 
 		 227 aa  47  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.125271  normal  0.0229196 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3867  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.78 
 
 		 257 aa  47  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  26.4 
 
 		 227 aa  46.6  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  22.46 
 
 		 225 aa  46.2  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1378  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.12 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0653452  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1856  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.59 
 
 		 225 aa  45.8  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01215  hypothetical protein  27.12 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.316454  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0272  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.62 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1395  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  27.12 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1337  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.12 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00180394  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0296  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.62 
 
 		 241 aa  45.8  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1711  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  27.12 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.163334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2396  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.12 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000178622 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.12 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00170587  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1912  respiratory nitrate reductase 1, gamma subunit  27.12 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0870039  normal  0.196031 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01205  nitrate reductase 1, gamma (cytochrome b(NR)) subunit  27.12 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.372615  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2894  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.26 
 
 		 240 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.104655  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.62 
 
 		 254 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1705  respiratory nitrate reductase gamma subunit  24.52 
 
 		 239 aa  44.7  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.06964  normal  0.118882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1774  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  27.53 
 
 		 225 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.079326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  23.57 
 
 		 220 aa  43.5  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03844  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.87 
 
 		 227 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  26.49 
 
 		 299 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>