35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0070 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 		 335 aa  677    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  85.89 
 
 		 334 aa  579  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  77.71 
 
 		 334 aa  546  1e-154  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  62.62 
 
 		 332 aa  414  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  61.89 
 
 		 330 aa  397  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  58.15 
 
 		 330 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  54.13 
 
 		 333 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  59.29 
 
 		 337 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  61.69 
 
 		 339 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  52.96 
 
 		 331 aa  369  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  53.73 
 
 		 342 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  51.99 
 
 		 331 aa  349  5e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  52.94 
 
 		 331 aa  347  2e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  50.77 
 
 		 331 aa  337  1.9999999999999998e-91  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  49.54 
 
 		 331 aa  335  5.999999999999999e-91  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  50 
 
 		 331 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  49.85 
 
 		 332 aa  321  8e-87  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  33.58 
 
 		 233 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  37.36 
 
 		 244 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  36.88 
 
 		 249 aa  129  7.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  34.33 
 
 		 248 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  33.1 
 
 		 255 aa  116  6.9999999999999995e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  31.09 
 
 		 289 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  32.22 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  29.96 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  32.39 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  27.17 
 
 		 220 aa  62  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  27.69 
 
 		 271 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  29.66 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  22.3 
 
 		 277 aa  53.1  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.27 
 
 		 234 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  25.9 
 
 		 302 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  24.58 
 
 		 302 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  22.66 
 
 		 261 aa  43.5  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  25.77 
 
 		 254 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>