38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0235 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 		 332 aa  674    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  63.55 
 
 		 330 aa  447  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  68.98 
 
 		 337 aa  448  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  61.56 
 
 		 333 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  62.95 
 
 		 330 aa  441  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  64.83 
 
 		 334 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  61.35 
 
 		 335 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  58.01 
 
 		 331 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  58.54 
 
 		 334 aa  404  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  56.51 
 
 		 342 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  54.08 
 
 		 331 aa  375  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  53.19 
 
 		 331 aa  367  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  51.36 
 
 		 331 aa  358  6e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  51.53 
 
 		 331 aa  355  5e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  50.92 
 
 		 331 aa  345  8e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  50.45 
 
 		 332 aa  340  2e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  52.6 
 
 		 339 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  38.2 
 
 		 244 aa  140  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  34.07 
 
 		 233 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  33.45 
 
 		 248 aa  133  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  36.4 
 
 		 249 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  34.26 
 
 		 255 aa  129  5.0000000000000004e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  29.28 
 
 		 271 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  29.26 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  25.38 
 
 		 255 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  25 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  28.52 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  26.17 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  27.9 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  38.1 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  24.81 
 
 		 257 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  24.35 
 
 		 299 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  25.32 
 
 		 277 aa  50.8  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  25.49 
 
 		 261 aa  46.6  0.0006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1445  nitrate reductase, gamma subunit  24 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  21.84 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.84 
 
 		 234 aa  43.5  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.15 
 
 		 233 aa  42.7  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>