38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1957 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 
248 aa  488  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  70.42 
 
 
255 aa  303  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  58.37 
 
 
249 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  56.9 
 
 
244 aa  241  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  48.03 
 
 
233 aa  205  6e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  37.74 
 
 
331 aa  160  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  36.24 
 
 
332 aa  160  1e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  33.33 
 
 
337 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  35.09 
 
 
333 aa  150  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  33.69 
 
 
334 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  36.8 
 
 
330 aa  149  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  35.93 
 
 
335 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  34.94 
 
 
330 aa  146  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  31 
 
 
342 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  34.28 
 
 
331 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  33.08 
 
 
334 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  33.69 
 
 
331 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  33.82 
 
 
332 aa  133  3e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  33.46 
 
 
339 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  31.82 
 
 
331 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  32.52 
 
 
331 aa  126  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  33.94 
 
 
331 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  32.91 
 
 
271 aa  86.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  30.73 
 
 
254 aa  82.4  0.000000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  31.45 
 
 
262 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  30.36 
 
 
255 aa  77  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  28.75 
 
 
255 aa  62  0.000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  29.24 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  27.88 
 
 
289 aa  59.7  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  25.79 
 
 
261 aa  58.9  0.00000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  24.7 
 
 
302 aa  57.4  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  27.01 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  27.81 
 
 
302 aa  56.2  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  25.1 
 
 
299 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  27.23 
 
 
257 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  25.82 
 
 
277 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0840  Nitrate reductase gamma subunit  26.42 
 
 
312 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000098802  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.1 
 
 
255 aa  42.4  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>