77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0049 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0049  nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 
233 aa  467  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000306057  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2191  Nitrate reductase gamma subunit  54.67 
 
 
249 aa  221  8e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.258292  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2479  putative DsrM protein  51.11 
 
 
244 aa  201  9e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1957  nitrate reductase, gamma subunit  48.03 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.344796  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1659  nitrate reductase, gamma subunit  49.78 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1602  nitrate reductase, gamma subunit  34.07 
 
 
330 aa  155  5.0000000000000005e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000153702  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  35.77 
 
 
333 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  34.43 
 
 
332 aa  152  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  34.69 
 
 
335 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1146  nitrate reductase, gamma subunit  32.6 
 
 
330 aa  148  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.247321  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1849  Nitrate reductase gamma subunit  32.6 
 
 
331 aa  148  9e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000160376  normal  0.155774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0270  Nitrate reductase gamma subunit  32.35 
 
 
337 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00809754  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  33.21 
 
 
331 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0136  nitrate reductase, gamma subunit  33.95 
 
 
331 aa  143  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00937433  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2271  nitrate reductase, gamma subunit, putative  32.1 
 
 
334 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.237982  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0037  Nitrate reductase gamma subunit  32.35 
 
 
331 aa  139  3.9999999999999997e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1775  nitrate reductase, gamma subunit  32.85 
 
 
334 aa  138  7.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377874  normal  0.253755 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0451  Nitrate reductase gamma subunit  33.21 
 
 
339 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.213571  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2313  Nitrate reductase gamma subunit  34.34 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0044  DsrM protein  33.46 
 
 
331 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.877712 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0450  nitrate reductase gamma subunit  31.67 
 
 
342 aa  124  2e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00150566  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1948  DsrM protein  32.47 
 
 
332 aa  122  4e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.542498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3199  nitrate reductase, gamma subunit  33.63 
 
 
271 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0033  Nitrate reductase gamma subunit  36.12 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2192  hypothetical protein  32 
 
 
255 aa  78.6  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0075  Nitrate reductase gamma subunit  29.69 
 
 
289 aa  64.3  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.506128  hitchhiker  0.00856354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  28.64 
 
 
262 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  31.97 
 
 
220 aa  56.2  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  26.77 
 
 
277 aa  55.5  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0172  nitrate reductase, gamma subunit  29.49 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  29.06 
 
 
256 aa  55.1  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0669  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.85 
 
 
241 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0113371  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1436  respiratory nitrate reductase gamma subunit  29.18 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0971317 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0608  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.55 
 
 
241 aa  52  0.000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  26.09 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1507  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  37.61 
 
 
233 aa  49.3  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0906  nitrate reductase, gamma subunit  25.2 
 
 
257 aa  48.9  0.00006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1333  respiratory nitrate reductase gamma subunit  31.85 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1228  nitrate reductase, gamma subunit  25 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.389364  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1445  nitrate reductase, gamma subunit  23.46 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1984  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.79 
 
 
225 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2638  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.86 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1957  nitrate reductase  23.91 
 
 
225 aa  46.2  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6187  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.32 
 
 
242 aa  45.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0410952  hitchhiker  0.00730194 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2312  respiratory nitrate reductase gamma subunit  35.9 
 
 
225 aa  45.8  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1528  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.09 
 
 
234 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000209931  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5444  Nitrate reductase  27.37 
 
 
242 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.187128  normal  0.153247 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2128  respiratory nitrate reductase subunit gamma  31.4 
 
 
229 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.833335  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1980  respiratory nitrate reductase subunit gamma  31.4 
 
 
229 aa  45.1  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.689777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5681  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.13 
 
 
254 aa  45.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.365468  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2305  respiratory nitrate reductase gamma subunit  32.76 
 
 
227 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.369875  normal  0.061235 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2161  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  31.4 
 
 
229 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1957  nitrate reductase, gamma subunit  30.58 
 
 
228 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0223608  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2589  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  33.33 
 
 
255 aa  45.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1963  quinone-interacting membrane-bound oxidoreductase complex subunit C  29.63 
 
 
407 aa  43.5  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00829701 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1935  nitrate reductase, gamma subunit  30.58 
 
 
229 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.840407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2278  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.75 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.339538  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3402  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.75 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3177  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  30.58 
 
 
229 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3598  nitrite transporter  31.03 
 
 
699 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0417643 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2256  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  35.78 
 
 
234 aa  43.1  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0442548  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2125  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  36.13 
 
 
254 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2182  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.82 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.292963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01435  hypothetical protein  29.82 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01423  nitrate reductase 2 (NRZ), gamma subunit  29.82 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2075  respiratory nitrate reductase 2, gamma subunit  29.82 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1549  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.82 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1646  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.82 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2191  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  29.82 
 
 
226 aa  42.4  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  24.48 
 
 
302 aa  42  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  23.04 
 
 
302 aa  42  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18690  respiratory nitrate reductase gamma subunit  28.97 
 
 
243 aa  42  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.073165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2138  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  28.93 
 
 
229 aa  42  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2561  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  34.86 
 
 
229 aa  42  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.40821  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2418  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.18 
 
 
225 aa  41.6  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2466  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  24.18 
 
 
225 aa  41.6  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1695  respiratory nitrate reductase 2 subunit gamma  29.91 
 
 
226 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.953876 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>