12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1445 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_1445  nitrate reductase, gamma subunit  100 
 
 		 302 aa  617  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  50 
 
 		 299 aa  302  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  40.14 
 
 		 302 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  40.15 
 
 		 277 aa  217  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  38.73 
 
 		 302 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0840  Nitrate reductase gamma subunit  32.55 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000098802  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  27.59 
 
 		 220 aa  97.1  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0256  Nitrate reductase gamma subunit  21.69 
 
 		 333 aa  53.1  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0703  Nitrate reductase gamma subunit  22.61 
 
 		 331 aa  50.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0396835  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0235  Nitrate reductase gamma subunit  23.56 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.911573  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1535  nitrate reductase, gamma subunit  26.4 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0070  Nitrate reductase gamma subunit  23.65 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.289973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>