10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0840 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0840  Nitrate reductase gamma subunit  100 
 
 		 312 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000098802  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0575  nitrate reductase gamma subunit  36.88 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0435677  normal  0.0173061 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0177  nitrate reductase, gamma subunit  37.96 
 
 		 302 aa  182  9.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.862434 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0338  nitrate reductase gamma subunit  37.59 
 
 		 302 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0229236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1445  nitrate reductase, gamma subunit  32.55 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0248  Nitrate reductase gamma subunit  31.33 
 
 		 299 aa  152  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1634  hypothetical protein  25 
 
 		 220 aa  70.9  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0343  nitrate reductase gamma subunit  26.92 
 
 		 256 aa  43.5  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0242574 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4233  respiratory nitrate reductase, gamma subunit  26.75 
 
 		 233 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0298613  normal  0.327714 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0852  nitrate reductase gamma subunit-like protein  25.93 
 
 		 261 aa  42.7  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>